| 应用16S rRNA高通量测序法比较人与常用实验动物口腔菌群的异同 |
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| 引用本文： | 顾东曙,陈傍柱,江霞,刘海月,那顺巴雅尔,周宏伟,顾为望. 应用16S rRNA高通量测序法比较人与常用实验动物口腔菌群的异同[J]. 中国比较医学杂志, 2016, 26(8): 96-102 |
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| 作者姓名： | 顾东曙 陈傍柱 江霞 刘海月 那顺巴雅尔 周宏伟 顾为望 |
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| 作者单位： | 南方医科大学实验动物中心, 广州 510515;南方医科大学实验动物中心, 广州 510515;南方医科大学实验动物中心, 广州 510515;南方医科大学公共卫生与热带医学学院, 广州 510515;广东医科大学, 东莞 523808;南方医科大学珠江医院检验医学部, 广州 510282;南方医科大学实验动物中心, 广州 510515;南方医科大学公共卫生与热带医学学院, 广州 510515;广东医科大学, 东莞 523808;南方医科大学珠江医院检验医学部, 广州 510282 |
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| 基金项目： | 广东省科技计划项目（编号：2013B030300040，2015A030302076）;东莞松山湖高新区生物医药外包服务基地建设（编号：2012B011000004）。 |
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| 摘 要： | ![]()
目的应用16S rRNA高通量测序法测定几种常用实验动物(西藏小型猪、比格犬、猕猴、新西兰兔、Wistar大鼠)的口腔菌群,并和人的口腔菌群进行对比分析,为口腔微生态的动物模型研究提供基础性资料。方法用一次性棉拭子采集西藏小型猪、比格犬、猕猴、新西兰兔、Wistar大鼠和人的口腔菌群标本,提取样品总DNA,使用带标签的通用引物扩增16S rRNA V4区片段,Illumina测序,经BIPES以及QIIME分析比较菌群多样性及结构。结果人与5种常用实验动物口腔菌群的丰富度均差异显著(P0.05),不同种类动物有其各自独特的口腔菌群,但猴的口腔菌群与人最为相似。结论根据与人口腔某类菌群的相似程度,5种动物中,猴口腔的梭菌属(Fusobacterium)、卟啉菌属(Porphyromonas)水平与人最相似,提示猴可能是研究人口腔菌群较适宜的模型动物。从特定菌门角度,西藏小型猪可能是研究与变形菌门(Proteobacteria)相关疾病的较适宜模型动物;比格犬可能是研究与螺旋体门(Spirochaetes)相关疾病的较适宜模型动物。
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| 关 键 词： | 实验动物 口腔菌群 16S rRNA 西藏小型猪 比格犬 猕猴 新西兰兔 Wistar大鼠 |
| 修稿时间： | 2016-05-02 |
Comparison of human and animal oral microbiota by Illumina sequencing of 16S rRNA tags |
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| GU Dong-shu,CHEN Bang-zhu,JIANG Xi,LIU Hai-yue,Nashun Bayaer,ZHOU Hong-wei and GU Wei-wang. Comparison of human and animal oral microbiota by Illumina sequencing of 16S rRNA tags[J]. Chinese Journal of Comparative Medicine, 2016, 26(8): 96-102 |
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| Authors: | GU Dong-shu CHEN Bang-zhu JIANG Xi LIU Hai-yue Nashun Bayaer ZHOU Hong-wei GU Wei-wang |
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| Affiliation: | Laboratory Animal Center of Southern Medical University, Guangzhou 510515, China;Laboratory Animal Center of Southern Medical University, Guangzhou 510515, China;Laboratory Animal Center of Southern Medical University, Guangzhou 510515, China;Department of Environmental Health, School of Public Health and Tropical Medicine, Southern Medical University, Guangzhou 510515;Guangdong Medical University, Dongguan 523808;Department of Laboratory Medicine of Zhujiang Hospital, Southern Medical University, Guangzhou 510282;Laboratory Animal Center of Southern Medical University, Guangzhou 510515, China;Department of Environmental Health, School of Public Health and Tropical Medicine, Southern Medical University, Guangzhou 510515;Guangdong Medical University, Dongguan 523808;Department of Laboratory Medicine of Zhujiang Hospital, Southern Medical University, Guangzhou 510282 |
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| Abstract: | ![]()
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| Keywords: | Laboratory animal Tibet minipig Beagle dog Rhesus monkey New Zealand white rabbit Wistar rat Oral microbiota 16S rRNA |
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