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重庆市HIV-1流行毒株的基因序列测定和亚型分析
引用本文:凌华,邢辉,韩梅,邱照铸,钱天学,王玉,王俊,邵一呜. 重庆市HIV-1流行毒株的基因序列测定和亚型分析[J]. 中国艾滋病性病, 2005, 11(5): 345-347
作者姓名:凌华  邢辉  韩梅  邱照铸  钱天学  王玉  王俊  邵一呜
作者单位:1. 重庆市疾病预防控制中心,重庆,400042
2. 中国疾病预防控制中心性病艾滋病预防控制中心,北京,100050
摘    要:
目的对重庆市流行的艾滋病(AIDS)病毒1型(HIV-1)进行分子流行病学调查,为艾滋病预防控制策略的制定提供依据.方法用套式聚合酶链反应(nested-PCR)对31份重庆市HIV-1抗体阳性者外周血单个核细胞(PBMC)中前病毒DNA的膜蛋白基因的C2-V3区,及其邻区300个核苷酸序列进行测定和分析.结果31份标本中有21份扩增阳性并得到相应序列,扩增率为67.6%.经过基因离散率计算和系统树分析后证实:1份标本为CRF01-AE流行重组毒株,20份标本为HIV-1 BC重组毒株.结论目前重庆市HIV-1 BC重组病毒为优势流行株,为有效控制HIV流行,需要重点在吸毒人群中开展行为干预措施.

关 键 词:艾滋病病毒1型 亚型 基因离散率 系统树分析
文章编号:1672-5662(2005)05-0345-03
收稿时间:2004-12-16
修稿时间:2005-01-25

Subtype and sequence analysis on HIV-1 strains circulating in Chongqing
LING Hua,XING Hui,HAN Mei,et al.. Subtype and sequence analysis on HIV-1 strains circulating in Chongqing[J]. Chinese JOurnal of Aids & STD, 2005, 11(5): 345-347
Authors:LING Hua  XING Hui  HAN Mei  et al.
Affiliation:Chongqing Center for Disease Control and Prevention, Chongqing 400042, China
Abstract:
Objective To identify the HIV-1 subtype distribution in Chongqing,and to further AIDS preventive strategy.Methods 21 DNA fragments of HIV-1 env gene were amplified by nested PCR from PBMC extracted from 31 subjects infected with HIV-1.The sequences of the env C_2-V_3 region were determined.Results 2 subtypes were identified circulating in Chongqing:CRF01-AE(n=1) and CRF-BC(n=20).The circulating recombinant form(CRF),CRF-BC,was the predominant strain.Conclusion The rapid spreading of CRF-BC among injecting drug users(IDU) may have important implications for HIV transmission as well as future intervention design.
Keywords:HIV- 1    Subtype   Genetic distance   Phylogenetic analysis
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