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豆蔻属药用植物DNA条形码鉴定研究
引用本文:石林春,宋经元,陈士林,姚辉,韩建萍.豆蔻属药用植物DNA条形码鉴定研究[J].世界科学技术,2010,12(3).
作者姓名:石林春  宋经元  陈士林  姚辉  韩建萍
作者单位:中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所,北京,100193 
基金项目:教育部博士点新教师基金 
摘    要:目的:针对鉴定十分困难的豆蔻属药用植物筛选适合其鉴定的DNA条形码序列,探索豆蔻属药用植物鉴定新方法.方法:对该属植物36个物种,46个样本的8个候选条形码序列(psbAtrnH,matK,rbcL,psbK-psbI,rpoB,atpB-rbcL,ITS,ITS2)进行PCR扩增、测序和序列分析,我们采用了4种方法对于数据进行分析,应用Mega4.1计算不同序列的种间和种内遗传距离(K-2P);用Wilcoxon秩和检验比较不同序列的变异性;用Taxon DNA软件评估"Barcoding Gap";用Blast、Distance方法检验物种鉴定的可靠性.结果:ITS2和ITS序列变异显著,物种水平鉴定成功率达100%,其它6个候选序列(psbA-trnH,matK,rbcL,psbK-psbI,rpoB,atpB-rbcL)不能有效鉴定豆蔻属物种.结论:本文推荐将ITS2和ITS作为豆蔻属药用植物潜在的DNA条形码序列,并依此建立该属药用植物的DNA条形码鉴定方法.

关 键 词:豆蔻属  DNA条形码  鉴定

Identification of Amomum(Zingiberaceae)through DNA Barcodes
Shi Linchun,Song Jingyuan,Chen Shilin,Yao Hui,Han Jianping.Identification of Amomum(Zingiberaceae)through DNA Barcodes[J].World Science and Technology(Modernization of Traditional Chinese Medicine),2010,12(3).
Authors:Shi Linchun  Song Jingyuan  Chen Shilin  Yao Hui  Han Jianping
Abstract:
Keywords:
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