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| 建立一种PCR产物直接测序检测HBVYMDD突变的方法 | |
| 引用本文： | 许彪,李晓东,刘志国,毛远丽,胡瑾华,王业东,徐东平. 建立一种PCR产物直接测序检测HBVYMDD突变的方法[J]. 中华检验医学杂志, 2009, 32(7) |
| 作者姓名： | 许彪 李晓东 刘志国 毛远丽 胡瑾华 王业东 徐东平 |
| 作者单位： | 1. 解放军第三○二医院传染病研究所病毒性肝炎研究室,北京,100039 2. 解放军第三○二医院检验中心,北京,100039 3. 解放军第三○二医院肝衰竭治疗研究中心,北京,100039 4. 解放军第三○二医院办公室,北京,100039 |
| 基金项目： | 国家重点基础研究发展规划(973计划)，北京市自然科学基金 |
| 摘 要： | 目的 建立检测HBV YMDD变异的PCR产物直接测序法,并与传统实时荧光PCR检测YMDD突变的结果进行比较分析.方法 选取103份慢性乙型肝炎患者血清标本,提取血清HBVDNA.用实时荧光PCR检测YMDD突变;用巢式pcR扩增HBV逆转录酶基因,对PCR产物进行DNA双向测序,NTI软件比对结果.采用Kappa一致性检验对DNA测序法检测的rt204位点突变与实时荧光PCR检测的YMDD突变结果进行比较.结果 PCR产物直接测序法可有效检测低病毒载量标本(500拷贝/ml)和高病毒载量(1010拷贝/ml)标本,同时可以避免高病毒载量标本的抑制效应.与实时荧光PCR相比较,YIDD突变检测符合率为100%,YVDD突变检测符合率97.1%,YIDD与YVDD共生突变符合率76.2%(Kappa=0.853,P<0.01).结论 本研究建立的PCR产物直接测序法检测HBV耐药相关基因突变,灵敏度高,检测范围宽,与实时荧光PCR检测结果有较高的符合率,并可同时检出YMDD、YIDD和YVDD. |
| 关 键 词： | 肝炎病毒,乙型 序列分析,DNA 聚合酶链反应 突变 |
Establishment of a PCR-product direct sequencing for the detection of HBV YMDD mutation |
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| XU Biao,LI Xiao-dong,LIU Zhi-guo,MAO Yuan-li,HU Jin-hua,WANG Ye-dong,XU Dong-ping. Establishment of a PCR-product direct sequencing for the detection of HBV YMDD mutation[J]. Chinese Journal of Laboratory Medicine, 2009, 32(7) | |
| Authors: | XU Biao LI Xiao-dong LIU Zhi-guo MAO Yuan-li HU Jin-hua WANG Ye-dong XU Dong-ping |
| Abstract: | |
| Keywords: | Hepatitis B virus Sequence analysis,DNA Polymerase chain reaction Mutation |
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