基于生物信息学、网络拓扑策略探究针灸治疗胃溃疡的机制

目的 运用文本挖掘、生物信息学、网络拓扑学等方法,探究针灸治疗胃溃疡的分子机制。方法 检索文献发现针刺后产生的活性化合物,通过STITCH和Swiss Target Prediction数据库获得其结合亲和力高的靶点。运用Cytoscape软件构建活性物质靶点基因蛋白质-蛋白质互作网络,通过DAVID数据库对治疗的关键靶点分别进行基因本体富集分析和京都基因组百科全书富集分析。结果 共鉴定了37个与针灸治疗胃溃疡相关的基因靶点,筛选了7条通路。结论 针刺治疗胃溃疡与镇痛、促进平滑肌收缩、改善情绪障碍等有关,包括的通路有神经活性配体-受体相互作用、c AMP信号通路、钙离子信号通路、5-羟色胺能突触等。