| 基于铁死亡相关基因的口腔鳞状细胞癌的生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 晏子钦,魏明波,程波.基于铁死亡相关基因的口腔鳞状细胞癌的生物信息学分析[J].临床口腔医学杂志,2022,38(1):19-22. |
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| 作者姓名： | 晏子钦 魏明波 程波 |
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| 作者单位： | 武汉大学中南医院口腔科 湖北 武汉 430071 |
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| 摘 要： | 目的:探究铁死亡相关基因在口腔鳞状细胞癌(OSCC)发生发展中的作用,初步确定潜在生物标志物.方法:从癌症基因组图谱数据库(TCGA)中下载头颈部鳞状细胞癌相关临床数据并筛选得到OSCC相关数据.利用R软件筛选差异表达的铁死亡相关基因并对差异表达基因进行GO和KEGG富集分析.利用STRING数据库构建蛋白质相互作用网络并利用R软件筛选关键基因.对关键基因进行Kaplan-Meier生存曲线绘制和Cox回归分析.结果:共筛选出44个铁死亡相关差异表达基因,进一步分析发现9个关键基因,其中IFNG和EGFR在OSCC组织中的表达水平与生存率显著相关(P<0.05).结论:铁死亡相关基因IFNG和EGFR可作为口腔鳞状细胞癌患者预后潜在的标志物.
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| 关 键 词： | 口腔鳞状细胞癌 铁死亡 生物信息学 差异表达 GO富集 KEGG富集 蛋白质相互作用 |
Bioinformatics analysis of oral squamous cell carcinoma based on the expression of ferroptosis-related genes |
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| YAN Zi-qin,WEI Ming-bo,CHENG Bo.Bioinformatics analysis of oral squamous cell carcinoma based on the expression of ferroptosis-related genes[J].Journal of Clinical Stomatology,2022,38(1):19-22. |
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| Authors: | YAN Zi-qin WEI Ming-bo CHENG Bo |
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