星形细胞瘤相关潜在基因及免疫浸润分析

目的 运用生物信息学筛选星形细胞瘤的相关核心基因.方法 从GEO数据库下载星形细胞瘤表达数据集GSE70231和GSE138999,采用RStudio分析后得到差异表达基因(DEGs).对DEGs进行GO和KEGG富集分析,应用STRING网站构建蛋白互作网络(PPI)后导入Cytoscape筛选核心基因.利用Sangerbox平台分析核心基因在肿瘤中的表达和对生存预后的影响.最后,利用RStudio对数据进行免疫浸润分析.结果 RStudio分析共1 261个DEGs;富集分析发现差异基因主要位于质膜和细胞质,参与化学突触传递和蛋白质结合等过程,与突触囊泡循环通路和胰岛素分泌通路相关.Cytoscape筛选出3个核心基因,分别是SNAP25、SYN1、SYT1.Sangerbox分析显示肿瘤与正常组织的核心基因表达存在明显的差别,并且高表达的核心基因整体生存相对较好.免疫浸润分析发现星形细胞瘤组织中,巨噬细胞(M1型和M2型)和中性粒细胞等浸润程度较高,而不同免疫细胞间也存在一定相关性.结论 SNAP25、SYN1、SYT1可能在星形细胞瘤发展过程中发挥作用,有望成为星形细胞瘤的潜在治疗靶点.