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用SSH方法构建BTCC患者尿脱落细胞差异表达基因的cDNA消减文库
引用本文:GUO Baihong,车团结,ZHANG Chong,李琳,SHI Baoguang,王建伟,CHEN Yirong. 用SSH方法构建BTCC患者尿脱落细胞差异表达基因的cDNA消减文库[J]. 临床泌尿外科杂志, 2008, 23(3): 222-227
作者姓名:GUO Baihong  车团结  ZHANG Chong  李琳  SHI Baoguang  王建伟  CHEN Yirong
作者单位:1. 兰州大学生命科学学院细胞生物学研究所
2. 甘肃省人民医院泌尿外科,兰州,730000
摘    要:
目的:应用抑制性消减杂交(SSH)方法构建膀胱移行细胞癌(BTCC)患者与正常人尿脱落细胞差异表达基因cDNA消减文库。方法:分别从BTCC患者与正常人尿液中提取总mRNA,用SMART技术反转录成cDNA,经过HaeⅢ酶切后将BTCC尿脱落细胞cDNA分为两组并接上接头,再与过量正常膀胱尿脱落细胞cD-NA进行两轮消减杂交及两轮抑制性聚合酶链反应(PCR),使得差异表达的DNA片段得以富集。PCR产物与T/A载体连接并转化大肠杆菌JM109构建成差异表达基因的cDNA消减文库。文库扩增后,随机挑取克隆进行酶切、测序及同源性分析。结果:PCR鉴定有317个克隆载有主要在200~900bp之间呈随机分布的插入片段,片段插入率达82.6%,证实建库成功。对20个质粒测序结果经同源性比对分析,其中20个片段源于17个已知基因,1个克隆在GenBank中未检索到与其有相似性的基因序列,表明它们可能为BTCC差异表达的新基因。结论:该消减杂交文库质量可靠,其成功构建为进一步筛选、克隆BTCC差异表达基因提供了依据。

关 键 词:膀胱移行细胞癌  基因差异表达  cDNA文库  抑制性消减杂交

Constructing the SSH cDNA library in urine exfoliated urothelial cells of bladder neoplasms and normal
GUO Baihong,CHE Tuanjie,ZHANG Chong,LI Lin,SHI Baoguang,WANG Jianwei,CHEN Yirong. Constructing the SSH cDNA library in urine exfoliated urothelial cells of bladder neoplasms and normal[J]. Journal of Clinical Urology, 2008, 23(3): 222-227
Authors:GUO Baihong  CHE Tuanjie  ZHANG Chong  LI Lin  SHI Baoguang  WANG Jianwei  CHEN Yirong
Abstract:
Keywords:Bladder transitional cell carcinoma  Gene differential expression  cDNA library  Suppression subtractive hybridization
本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录!
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