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基于生物信息学分析剪接因子SRSF11在胃癌中的表达及临床意义
作者姓名:喻莹  刘玉婷  黎桂珍  梁景皓  李彬彬
作者单位:1. 广东医科大学基础医学院病理生理学教研室;2. 广东医科大学基础医学院生物技术系
基金项目:国家自然科学基金(81502411);;广东省自然科学基金(2023A1515010448);
摘    要:目的 基于数据库分析剪接因子SRSF11在胃癌中的表达及其与临床病理特征、预后的关系,并探讨相关机制。方法 基于癌症基因组图谱(TCGA)、基因表达综合(GEO)数据库分析SRSF11在胃癌中的表达情况;利用UALCAN、KM Plotter评估SRSF11表达与临床病理特征、预后的关系;利用TIMER工具分析SRSF11表达对肿瘤微环境免疫细胞浸润的影响;结合TCGA spliceSeq中可变剪接数据和RNA-seq数据分析SRSF11调控的可变剪接事件和基因,并对靶基因进行基因本体论(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析。结果 胃癌组织中SRSF11表达明显上调(P <0.05),且与患者淋巴结转移和TP53基因突变有关(P <0.05);SRSF11高表达与胃癌患者预后不良相关(P <0.001);SRSF11表达可影响胃癌中多种免疫细胞的浸润水平,巨噬细胞高浸润量与患者预后不良相关(P <0.05);靶基因KEGG富集分析显示主要参与病毒感染、溶酶体、三磷酸腺苷结合盒转运体和肿瘤相关信号通路等。结论 SRSF11在胃癌组织中呈现高表达,且...

关 键 词:胃癌  SRSF11  可变剪接  生物信息学
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