| 前列腺癌相关基因及功能的生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 何宜宸,孙浩,焦志敏,周洋,王诚悦,张金虎,陈兵海. 前列腺癌相关基因及功能的生物信息学分析[J]. 江苏大学学报(医学版), 2019, 29(3): 258-263 |
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| 作者姓名： | 何宜宸 孙浩 焦志敏 周洋 王诚悦 张金虎 陈兵海 |
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| 作者单位： | (1. 江苏大学医学院, 江苏 镇江 212013; 2. 江苏大学附属医院泌尿外科, 江苏 镇江 212001) |
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| 摘 要： | ![]()
目的: 利用生物信息学方法和体外实验,寻找前列腺癌发生的关键基因。方法: 从GEO 数据库下载基因芯片数据 GSE60502,其中包括48例正常前列腺组织样本和47例前列腺癌组织样本。利用Morpheus(https:∥software.broadinstitute.org／morpheus／)在线工具分析前列腺癌组织和正常前列腺组织的差异表达基因,然后使用GCBI(https:∥www.GCBI.com.cn)在线进行差异表达基因的基因本体富集论(gene ontology,GO)分析、Pathway分析,对同时参与GO分析和Pathway分析的差异基因取交集,构建基因共表达网络和基因相互作用网络。最后通过CCK8实验进行验证。结果： 共筛选出6 903个表达差异的基因,差异最大的前15个基因中,有上调基因9个,下调基因6个,其中表达差异最大的基因为CRISP3。GO分析提示差异基因主要参与的分子生物学过程包括小分子代谢过程、信号转导、DNA依赖的转录过程、RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调节等。Pathway分析提示差异基因主要参与的通路包括PI3K-Akt信号通路、代谢途径、MAPK信号通路以及Wnt信号通路等。CACNA1A基因位于共表达网络的核心位置,而ADCY5、PIK3CB基因位于基因相互作用网络的核心位置。 体外CCK8实验证实下调CACNA1A表达可明显抑制前列腺癌细胞增殖能力。 结论： CRISP3、CACNA1A、ADCY5、PIK3CB基因可能是影响前列腺癌发生的关键基因。
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| 关 键 词： | 生物信息学分析 前列腺癌 CACNA1A CRISP3 ADCY5 PIK3CB
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| 收稿时间： | 2018-11-12 |
Bioinformatics analysis of prostate cancer related genes and its function |
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| HE Yi-Chen,SUN Hao,JIAO Zhi-Min,ZHOU Yang,WANG Cheng-Yue,ZHANG Jin-Hu,CHEN Bing-Hai. Bioinformatics analysis of prostate cancer related genes and its function[J]. Journal of Jiangsu University Medicine Edition, 2019, 29(3): 258-263 |
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| Authors: | HE Yi-Chen SUN Hao JIAO Zhi-Min ZHOU Yang WANG Cheng-Yue ZHANG Jin-Hu CHEN Bing-Hai |
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| Affiliation: | （1. School of Medicine, Jiangsu University, Zhenjiang Jiangsu 212013; 2. Department of Urinary Surgery, the Affiliated Hospital of Jiangsu University, Zhenjiang Jiangsu 212001,China) |
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| Abstract: | ![]()
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