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基于转录组测序揭示适度干旱胁迫对甘草根基因表达的调控
作者姓名:张春荣  桑雪雨  渠萌  唐晓敏  程轩轩  潘利明  杨全
作者单位:广东药学院 中药学院, 广东 广州 510006,广东药学院 中药学院, 广东 广州 510006,广东药学院 中药学院, 广东 广州 510006,广东药学院 中药学院, 广东 广州 510006,广东药学院 中药学院, 广东 广州 510006,广东药学院 中药学院, 广东 广州 510006,广东药学院 中药学院, 广东 广州 510006;中国中医科学院 中药资源中心 道地药材国家重点实验室培育基地, 北京 100700
基金项目:国家自然科学基金项目(81173488);中医药行业科研专项(201207002);中国中医科学院自主选题研究项目(2011ZDXK-01);中国中医科学院中药资源中心项目(KFKT2013005);广东省中医药局建设中医药强省科研项目(20142090)
摘    要:适度干旱胁迫可促进甘草有效成分的积累,提高药材质量。该研究以栽培6个月的甘草根为材料,设置适度干旱胁迫组(土壤相对含水量40%~45%)和对照组(土壤相对含水量70%~75%),分别应用Illumina HiSeq 2000进行转录组双末端测序,分析甘草根响应适度干旱胁迫的差异表达基因。在适度干旱胁迫组和对照组中分别得到80 490 490,82 588 278个Clean reads,经序列拼接和去冗余处理分别得到94 828,305 100个Unigene序列,序列长度的中位数分别为1 007,1 125 nt。差异表达基因分析表明,适度干旱胁迫抑制细胞壁中β-木糖苷酶、天冬酰胺酰内肽酶、GDP-L-岩藻糖合酶等酶的基因表达,可能抑制根细胞的初生壁降解与程序性细胞死亡;促进萜类、黄酮类化合物生物合成的关键酶基因的表达,进而促进甘草有效成分的积累;促进生长素、乙烯、细胞分裂素的生物合成和信号转导,进而促进根的发生和细胞增殖;促进脱落酸、茉莉酸的生物合成和信号转导,进而提高甘草对干旱胁迫的适应能力;抑制赤霉素、油菜素内酯等激素的生物合成和信号转导,进而抑制地上茎的伸长。

关 键 词:甘草  干旱胁迫  转录组测序  次级代谢  植物激素
收稿时间:2015-06-15
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