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| 大劣按蚊TEP1 cDNA的克隆和生物信息学分析 | |
| 引用本文： | 胡晓飞,王英,潘春江,刘涛,谢佳,何谐,姜晓梅,黄复生.大劣按蚊TEP1 cDNA的克隆和生物信息学分析[J].第三军医大学学报,2009,31(11). |
| 作者姓名： | 胡晓飞 王英 潘春江 刘涛 谢佳 何谐 姜晓梅 黄复生 |
| 作者单位： | 1. 第三军医大学学员旅7队,重庆,400038;第三军医大学基础医学部病原生物学教研室,重庆,400038 2. 第三军医大学基础医学部病原生物学教研室,重庆,400038 3. 第三军医大学学员旅7队,重庆,400038 4. 第三军医大学学员旅20队,重庆,400038 5. 第三军医大学学员旅21队,重庆,400038 |
| 基金项目： | 国家自然科学基金，第三军医大学基础部学员创新基金 |
| 摘 要： | 目的 克隆大劣按蚊(Anopheles dirus)含硫酯键蛋白1(thioester-containing protein 1,TEP1)的cDNA,并分析其序列.方法 根据已报道的冈比亚按蚊等多种昆虫的TEP1氨基酸保守序列设计简并引物,以大劣按蚊血淋巴细胞总RNA为模板,进行RT-PCR扩增.对目的 片段纯化回收,经TA克隆后测定其核苷酸序列.利用DNASIS程序分析该序列,并推导其氨基酸序列,最后利用BLAST和DNASIS等进行不同昆虫TEP1氨基酸序列的比对.结果 RT-PCR扩增出一约770 bp的条带,TA克降后DNA测序发现,阳性克隆的核苷酸序列长774 bp,推导其氨基酸序列长258 aa.生物信息学分析表明,该序列与冈比亚按蚊、阿拉伯按蚊、斯氏按蚊TEP1基因的氨基酸序列同源性分别达72%、72%和59%,与冈比亚按蚊的TEP4氨基酸序列同源性为59%.结论 从大劣按蚊血淋巴细胞中成功克隆出了TEP1的cDNA部分序列. |
| 关 键 词： | 大劣按蚊 生物信息学 天然免疫 |
Cloning and bioinformatic analysis of cDNA fragment of TEP1 gene of Anopheles dirus |
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| HU Xiao-fei,WANG Ying,PAN Chun-jiang,LIU Tao,XIE Jia,HE Xie,JIANG Xiao-mei,HUANG Fu-sheng.Cloning and bioinformatic analysis of cDNA fragment of TEP1 gene of Anopheles dirus[J].Acta Academiae Medicinae Militaris Tertiae,2009,31(11). | |
| Authors: | HU Xiao-fei WANG Ying PAN Chun-jiang LIU Tao XIE Jia HE Xie JIANG Xiao-mei HUANG Fu-sheng |
| Institution: | HU Xiao-fei1,2,WANG Ying2,PAN Chun-jiang1,LIU Tao1,XIE Jia3,HE Xie2,JIANG Xiao-mei4,HUANG Fu-sheng2(17th Student Team,2Department of Pathogenic Biology,College of Basic Medical University,320th Student Team,421st Student Team,Third Military Medical University,Chongqing 400038,China) |
| Abstract: | Objective To clone the cDNA fragment of thioester-containing protein 1(TEP1) of Anopheles dirus and analyze the sequence with bioinformatic methods.Methods The target cDNA fragment was amplified by RT-PCR with degenerated primers designated based on the conserved amino acid sequences of TEP1 of Anopheles gambiae and other insects.And total RNA from haemocytes of Anopheles dirus was used as the template of RT-PCR.The PCR product was purified and T/A cloned,followed by sequencing the positive clone.Then the s... |
| Keywords: | TEP1 RT-PCR |
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