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河南省人免疫缺陷病毒流行株的基因亚型分析
引用本文:韩卫国,苏玲,王哲,邵一鸣,王春俭,李宏. 河南省人免疫缺陷病毒流行株的基因亚型分析[J]. 中华传染病杂志, 1999, 17(4): 253-255
作者姓名:韩卫国  苏玲  王哲  邵一鸣  王春俭  李宏
作者单位:1. 河南省卫生防疫站,郑州,450003
2. 卫生部艾滋病预防与控制中心
摘    要:目的 研究流行于河南省献血员中的人免疫缺陷病毒(HIV) 外膜蛋白(env) 基因亚型。方法 提取HIV 感染者外周血单个核白细胞(PBMC) 的DNA,经套式聚合酶链反应(NestedPCR) 扩增env 基因片断,对C2V3 区350 ~450 核苷酸顺序进行测定和分析。结果 20 份样品的env 基因序列与B亚型最为接近,基因离散率为8 .34 % ,与其它国际亚型的基因离散率在20 % 以上;与流行于云南的B 亚型毒株基因离散率为4 .18 % ;样品间的基因离散率为3 .4 % 。结论 流行于河南省献血员中的HIV 属B亚型,并与云南的流行株密切相关;其在河南的流行时间在3 ~6 年间。

关 键 词:人获得性免疫缺陷病毒Ⅰ型  基因亚型  变异

Genomic subtypes of HIV-1 in Henan province
HAN Weiguo,SULing,WANGZhe,et al.. Genomic subtypes of HIV-1 in Henan province[J]. Chinese Journal of Infectious Diseases, 1999, 17(4): 253-255
Authors:HAN Weiguo  SULing  WANGZhe  et al.
Affiliation:HAN Weiguo,SULing,WANGZhe,et al. Henan Health and Anti Epidemic Center,Zhengzhou 450003
Abstract:Objective Toidentify HIV 1 envelope sequence subtypesin infected blood donorsfrom Henan province. Methods DNAextracted from PBMCwere amplifiedin the presence ofenvfragment by nested PCR.The C2 V3 region was sequenced and a phylogenetic tree was constructed . Results The overallenv gene divergenceis8 .34 % between samples with HIV 1 Bsubtype,and 4 .18 % with reference strains of Yunnan origin .Thesample gene divergence with othersubtypes A,C,D,Eis over 23 % .The innergroup gene divergenceofsamplesis3 .4 % .The globally predominant GPGQsequenceatthetip of V3 motifisfoundin 11 strains (55 % ) ,typical European GPGRsequence were found in 7 strains (35 % ) . Twostrains contain a GPGKsequence. Conclusion These findings suggest the epidemic ofsubtype Bof HIV 1 in Henan province anditisclosely related tothoseidentifiedin Yunnan province.
Keywords:HIV 1 Genomicsubtype Variability
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