| 摘 要： | 目的探讨胶质瘤细胞中长非编码RNA 00467(LINC00467)通过竞争性内源RNA(ceRNA)机制调控丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶3基因(RIPK3)与肿瘤微环境(TME)及药敏性的关系及其机制。方法对癌症基因组图谱(TCGA)数据库和基因型-组织表达(GTEx)数据库胶质瘤及正常脑组织基因表达进行分析, 筛选差异表达基因(DEGs)(P<0.01且表达变化大于2倍的基因), 确定有意义的长链非编码RNA(lncRNA)-mRNA关系对, 进行生存分析。在Starbase v3.0数据库中筛选微小RNA(miRNA, miR)-lncRNA关系对, 确定ceRNA。在metascape、TISCH、CancerSEA数据库进行分析。取25例新鲜胶质瘤组织及25例正常脑组织, 应用荧光实时定量反转录聚合酶链反应(qRT-PCR)检测基因表达。应用R软件包及SPSS统计分析软件对结果进行处理。结果对TCGA和GTEx表达谱进行差异表达分析, 发现6 095个差异表达的lncRNA(3 083上调, 3 012下调)和10 164个差异表达的mRNA(6 803上调, 3 361下调...
|
