人参属植物鲨烯环氧酶编码基因的生物信息学分析 |
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引用本文: | 金健,吴亚运,晏旋,黄勋,张绍鹏.人参属植物鲨烯环氧酶编码基因的生物信息学分析[J].湖北预防医学杂志,2016(3):9-12. |
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作者姓名: | 金健 吴亚运 晏旋 黄勋 张绍鹏 |
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作者单位: | 武汉轻工大学,武汉,430023 |
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基金项目: | 湖北省教育厅科学研究青年项目(Q20141704) |
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摘 要: | 目的 对人参属植物的三萜皂苷生物合成途径中的鲨烯环氧酶及其编码基因进行分子层面的分析研究.方法 从Genbank中找到目前已公布的所有人参属植物的鲨烯环氧酶基因序列信息,利用生物信息学方法对这些序列进行开放阅读框、编码氨基酸和进化关系树进行了初步的预测和分析.结果 不同物种间的鲨烯环氧酶基因在核苷酸和氨基酸平均相似性以及结构分析表明14种鲨烯环氧酶编码基因在人参属植物中是稳定的.对人参属的14种鲨烯环氧酶进行聚类分析发现可以将其分为3类.结论 通过生物信息学方法对人参属植物鲨烯环氧酶及其编码基因进行分析,可以为鲨烯环氧酶基因以及三萜皂苷途径的分子生物学研究提供理论上的依据和指导资料.
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关 键 词: | 人参属 鲨烯环氧酶 理化性质 生物信息学分析 |
Bioinformatics analysis of squalene epoxidase coding gene in Panax genus |
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Abstract: | |
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Keywords: | Panax genus Squalene epoxidase (SE) Physical and chemical properties Bioinformatics methods |
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