| ATRNL1在阿尔茨海默病中的基因功能分析及ceRNA网络预测 |
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| 引用本文： | 钟斯然,邝琦,覃宁,杨斯漫,韦宇婷,陈奔,钟振国,张帆.ATRNL1在阿尔茨海默病中的基因功能分析及ceRNA网络预测[J].重庆医科大学学报,2022,47(7):871-876. |
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| 作者姓名： | 钟斯然 邝琦 覃宁 杨斯漫 韦宇婷 陈奔 钟振国 张帆 |
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| 作者单位： | 1.广州华商学院健康医学院,广州 511399;2.广西中医药大学科学实验中心,南宁 530021;3.广州中医药大学国际中医药转化医学研究所,广州 510006 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目（编号：81660644）；江苏省自然科学青年基金资助项目（编号：BK20170267）；广州华商学院青年学术基金资助项目（编号：2021HSQX53）；广西一流学科建设专项基金资助项目（编号：05019038）。 |
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| 摘 要： | 目的：通过对ATRNL1基因的生物信息学分析，明确其在阿尔茨海默病（Alzheimer’s disease,AD）中的作用。方法：通过高通量基因表达（gene expression omnibus,GEO）数据库下载AD芯片数据GSE36980、GSE1297和GSE28146，利用3个独立数据验证ATRNL1在AD中的差异表达情况，并计算Pearson相关系数分析ATRNL1与临床信息的相关性；使用GSE1297数据筛选ATRNL1共表达基因并使用clusterProfiler程序包进行基因功能注释，包括基因本体论（gene ontology,GO）和京都基因与基因组百科全书（Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG）富集分析；为研究ATRNL1差异表达的调控机制，使用multiMiR程序包下载miRNA相互作用数据，根据竞争性内源RNA(competing endogenous RNAs,ceRNA)的调控机制构建ATRNL1-miRNA-mRNA调控网络。结果：3个独立芯片数据中ATRNL1在AD中表达明显下降（P<0.05）...
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| 关 键 词： | 阿尔茨海默病 ATRNL1 谷胱甘肽能突触 hsa-miR-192-5p 竞争性内源RNA MOAP1 |
| 收稿时间： | 2020/4/8 0:00:00 |
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