| 基于N6-甲基腺苷修饰与免疫细胞浸润的结直肠癌预后模型构建及验证 |
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| 作者姓名： | 杨菁菁 郭怀娟 茅静贤 王佳欣 王颖 严雪冰 潘晓萍 |
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| 作者单位： | 1. 扬州大学附属医院肿瘤科;2. 扬州大学附属医院健康管理中心 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(81902422);;江苏省基础研究计划自然科学基金面上项目(BK20231245);;江苏省研究生科研创新计划项目(KYCX23＿3621);;江苏省研究生实践创新计划项目(SJCX23＿2027,SJCX21-1646); |
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| 摘 要： | 目的 探讨N6-甲基腺苷(m6A)修饰相关基因和免疫细胞浸润在结直肠癌(CRC)中的预后价值并构建相应风险模型预测患者临床结局。方法 从癌症基因组图谱(TCGA)和基因表达综合数据库(GEO)下载CRC患者的肿瘤组织转录组数据及匹配临床信息,通过共识聚类及单样本基因组富集分析明确m6A修饰相关基因及免疫细胞浸润在CRC中的预后价值。基于加权基因共表达网络分析(WGCNA)筛选与两者相关的预后基因,运用Lasso回归分析构建多基因风险模型,并在基因表达谱交互分析(GEPIA)数据库中对筛选出的预后基因进行表达差异分析。通过Kaplan-Meier生存分析明确风险模型在不同亚组及外部验证队列中的预测效能。结果 基于21个m6A修饰相关基因及24个免疫细胞浸润的特征表型均可以显著区分TCGA队列中CRC患者预后。CRC组织中多数m6A修饰相关基因与免疫细胞浸润显著相关。WGCNA及Lasso回归分析筛选出4个预后基因,分别为内凝集蛋白1、淋巴细胞抗原6复合位点G6D、无调性同族体1和基质金属蛋白酶28。在...
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| 关 键 词： | 结直肠癌 N6-甲基腺苷修饰相关基因 免疫细胞浸润 生物标志物 预后 |
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