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基于转录组测序的煤工尘肺大鼠模型中线粒体相关差异基因筛选及分析
作者姓名:刘道伟  张娜  刘琭璐  章梅  杨惠芳
作者单位:1. 宁夏医科大学公共卫生学院;2. 宁夏环境因素与慢性病控制重点实验室
基金项目:宁夏回族自治区重点研发计划项目(2023BEG02028);宁夏回族自治区重点研发计划一般项目(2021BEB04059);;国家自然科学基金项目(82160608);;宁夏自然科学基金项目(2022AAC03141,2021AAC02013);
摘    要:
目的 应用高通量转录组测序技术,对煤工尘肺大鼠模型中线粒体相关差异基因进行筛选及分析。方法 选取无特定病原体(SPF)级SD雄性大鼠30只,根据随机数表法分为对照组、煤尘组、矽尘组,每组10只,采用一次性非暴露式气管内灌注法造模,并常规饲养90 d。取肺组织制作病理标本,观察其病理改变,采用Masson染色观察其纤维化情况,免疫组化检测肺组织的胶原蛋白Ⅰ(COL-Ⅰ)表达情况来确定造模情况。利用转录组测序技术对样本间基因进行差异表达分析,筛选出差异表达基因,然后对差异基因进行GO和KEGG生物信息学分析,进一步筛选出大鼠煤工尘肺模型中与线粒体有关的差异基因,并进行生物信息学分析。结果 HE、Masson染色及免疫组化结果显示,煤尘组与矽尘组中COL-Ⅰ表达量增高。对对照组与煤尘组的差异基因进行筛选,其中与线粒体有关的基因一共35个(上调28个和下调7个)。对对照组与矽尘组的差异基因进行筛选,其中与线粒体有关的基因一共302个(上调202个和下调100个)。通过GO富集分析发现,在生物过程中,细胞过程、单一的有机体过程较为重要;在分子功能中,以活动分子传感器、催化活性为主;在细胞组分中,...

关 键 词:煤工尘肺  转录组测序  线粒体  肺纤维化
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