| RAW264.7细胞自噬相关circRNA检测及分析 |
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| 引用本文： | 张爱君,李艳宁,高倩,屈昱良,蒋丹,王丽燕,徐广贤. RAW264.7细胞自噬相关circRNA检测及分析[J]. 免疫学杂志, 2022, 38(2): 177-184 |
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| 作者姓名： | 张爱君 李艳宁 高倩 屈昱良 蒋丹 王丽燕 徐广贤 |
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| 作者单位： | 750001银川,宁夏医科大学临床医学院;710000西安,空军军医大学附属医院检验科;750001银川,宁夏医科大学临床医学院;523000东莞,广东医科大学医学技术学院医学检验系 |
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| 基金项目： | 宁夏重点研发计划(社发领域)重点项目。 |
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| 摘 要： | 目的探讨环状RNA（circRNA）表达谱在RAW264.7细胞自噬模型中的差异表达及其在细胞自噬过程中的调控作用。方法利用雷帕霉素（rapamycin, RAPA）和3-甲基腺嘌呤（3-methyladenine, 3-MA）分别作用于小鼠单核巨噬细胞RAW264.7细胞,建立自噬诱导模型和自噬抑制模型;提取各组细胞总RNA,基于高通量测序技术获得差异表达的circRNA;运用生物信息学分析对circRNA可能结合的微小RNA（miRNA）及其可能参与自噬的分子通路进行预测。结果在RAPA组和3-MA组中呈现相反表达趋势的circRNA共有42个,差异显著的前5个circRNA分别是circRNAmmucirc0000353、mmucirc0001704、mmucirc0013108、mmucirc0001528和mmucirc0015842,分别对其结合匹配值较高的...
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| 关 键 词： | 细胞自噬 circRNA 高通量测序 生物信息学 |
Detection and analysis of autophagy-related circRNA in RAW264.7 cells |
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| ZHANG Aijun,LI Yanning,GAO Qian,QU Yuliang,JIANG Dan,WANG Liyan,XU Guangxian. Detection and analysis of autophagy-related circRNA in RAW264.7 cells[J]. Immunological Journal, 2022, 38(2): 177-184 |
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| Authors: | ZHANG Aijun LI Yanning GAO Qian QU Yuliang JIANG Dan WANG Liyan XU Guangxian |
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| Affiliation: | (School of Clinical Medicine,Ningxia Medical University,Yinchuan 750004,China;Department of Laboratory Medicine,Affiliated Hospital of Air Force Military Medical University,Xi'an 710000,China;Department of Medical Laboratory Medicine,School of Medical Technology,Guangdong Medical University,Dongguan 523000,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Autophagy circRNA High-throughput sequencing Bioinformatics |
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