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结核分枝杆菌北京基因型菌株新型分子遗传标志的鉴定
引用本文:姜昕,高峰,王易,张文宏,胡忠义,王洪海.结核分枝杆菌北京基因型菌株新型分子遗传标志的鉴定[J].中华传染病杂志,2007,25(9):528-533.
作者姓名:姜昕  高峰  王易  张文宏  胡忠义  王洪海
作者单位:1. 上海中医药大学病原生物学教研室,201203
2. 上海交通大学附属第一人民医院病理科
3. 复旦大学附属华山医院传染科
4. 同济大学附属肺科医院上海市结核重点实验室
5. 复旦大学生命科学学院遗传学研究所
摘    要:目的分析结核分枝杆菌北京基因型菌株与非北京基因型菌株间差异表达的蛋白质,寻找可用于快速区分北京基因型的分型标志。方法应用间隔寡核苷酸分型法对56株结核分枝杆菌进行基因分型,经双向电泳技术比较北京基因型菌株与非北京基因型菌株的全菌蛋白表达图谱差异,差异表达的蛋白质通过基质辅助激光解吸-电离飞行时间质谱仪进行质谱分析,蛋白质数据库进行检索。进而对差异表达的蛋白质相应基因及上游进行序列分析。结果56株结核分枝杆菌中有49株为北京型菌株,7株为非北京型菌株。两个基因型菌株中差异明显表达的蛋白质为Rv0927c,该蛋白质斑点在49株北京基因型菌株中均缺失,而在7株非北京菌株和H37Rv中均有出现。北京基冈型菌株Rv0927c基因有两个特征性突变:在421位核苷酸位点的AGC3个碱基缺失,以及该基因上游127位点G—A的突变;而非北京基因型菌株该基因及其上游序列与H37Rv完全相同。结论 Rv0927c基因在北京基因型菌株中的特征性突变,对开发新型区分北京基因型和非北京基因型结核分枝杆菌的方法奠定了基础。

关 键 词:分枝杆菌  结核  北京基因型  蛋白质组  遗传标记  突变
修稿时间:2006-12-28

Identification of novel genetic markers in Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype strains
JIANG Xin,GAO Feng,WANG Yi,ZHANG Wen-hong,HU Zhong-yi,WANG Hong-hai.Identification of novel genetic markers in Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype strains[J].Chinese Journal of Infectious Diseases,2007,25(9):528-533.
Authors:JIANG Xin  GAO Feng  WANG Yi  ZHANG Wen-hong  HU Zhong-yi  WANG Hong-hai
Institution:Department of Pathogen and Microbiology, Shanghai University of Traditional Chinese Medicine, Shanghai 201203, China
Abstract:
Keywords:Mycobacterium tuberculosis  Beijing genotype  Proteome  Genetic markers  
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