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宏基因组二代测序技术在呼吸系统感染病原学诊断中的应用价值
作者姓名:吴瑞珊  刘婉婷  龙天娣  包秉弘  丁新  周树勤  龙军
作者单位:1. 广东省生殖科学研究所(广东省生殖医院),国家卫生健康委员会男性生殖与遗传重点实验室;2. 南方医科大学珠江医院检验医学部;3. 南方医科大学珠江医院麻醉科
基金项目:国家自然科学基金(81760664);;广东省医学科学技术研究基金项目(A2020373);
摘    要:
目的 探讨宏基因组二代测序技术(m NGS)在呼吸系统感染病原学诊断中的应用价值。方法 选取2020年12月-2021年1月在南方医科大学珠江医院就诊的48例呼吸系统感染者为研究对象,比较痰mNGS检测和痰培养检出病原体的分布、阳性率、符合率、混合感染率,对检出的部分特殊病原体采用PCR、质谱技术进行验证,分析痰mNGS检测的优势和可行性。结果 痰mNGS检出75株病原体,其中细菌20株,真菌24株,病毒16株,特殊病原体15株;痰培养检出20株病原体,其中细菌8株,真菌11株,特殊病原体1株。痰mNGS与痰培养检测病原体总符合率为35.42%(17例),阳性符合率为22.92%(11例)。痰mNGS检测病原体阳性率87.50%(42例)和混合感染率60.42%(29例)均显著高于痰培养的阳性率29.17%(14例)和混合感染率8.33%(4例),差异均有统计学意义(χ2=32.685、28.860,P均<0.05)。特殊病原体鹦鹉热衣原体、结核分枝杆菌复合群(MTB)和诺卡菌,验证结果与痰mNGS检测符合率均为100.00%(各2例)。鹦鹉热衣原体患者根据...

关 键 词:呼吸系统感染  宏基因组二代测序技术  痰培养
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