| 基于转录组信息的甘松MADS-box转录因子家族分析 |
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| 引用本文： | 崔琪,俸明康,丰日落,王涛,张绍山,李莹,陈晨,刘圆.基于转录组信息的甘松MADS-box转录因子家族分析[J].中草药,2023,54(3):898-906. |
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| 作者姓名： | 崔琪 俸明康 丰日落 王涛 张绍山 李莹 陈晨 刘圆 |
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| 作者单位： | 西南民族大学药学院, 四川 成都 610041;四川省羌彝药用资源保护与利用技术工程实验室, 四川 成都 610225;青藏高原民族药用资源保护与利用国家民委重点实验室, 四川 成都 610225;西南民族大学青藏高原研究院, 四川 成都 610225;四川省羌彝药用资源保护与利用技术工程实验室, 四川 成都 610225;青藏高原民族药用资源保护与利用国家民委重点实验室, 四川 成都 610225 |
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| 基金项目： | 国家重点研发计划（2018YFC1706101）；四川省自然科学基金项目（2022NSFSC1588）；2021年国家民委领军人才支持计划，西南民族大学研究生创新型科研项目（CX2021SZ94） |
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| 摘 要： | 目的 基于转录组数据筛选鉴定分析甘松Nardostachys jatamansi MADS-box转录因子家族。方法 利用生物信息学的方法全面分析甘松MADS-box基因家族成员的蛋白理化性质、亚细胞定位、基因结构、导肽、信号肽及跨膜结构域、系统进化树。结果 在甘松转录组数据中共鉴定出20个MADS-box转录因子，含有90～365个氨基酸，相对分子质量在10 179.96～41 707.68，理论等电点范围为4.87～10.43，主要在细胞核表达，均含有MADS保守结构域，均不含信号肽、导肽以及跨膜结构域。系统发育分析表明甘松MADS蛋白主要属于TypeII型。结论 利用生物信息学分析手段，鉴定了甘松MADS-box家族转录因子，为甘松深入研究甘松MADS-box蛋白的生物学功能提供参考，为甘松的药用成分合成调控机制提供研究基础，为培育优质甘松新品种提供依据。
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| 关 键 词： | 甘松 MADS-box 转录因子分析 花器官 亚细胞定位 |
| 收稿时间： | 2022/10/6 0:00:00 |
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