| 长链非编码RNA的保守性及其在非模式生物长链非编码RNA筛选中的应用 |
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| 引用本文： | 姜贵先,罗溪,张露露,刘青,肖良.长链非编码RNA的保守性及其在非模式生物长链非编码RNA筛选中的应用[J].第二军医大学学报,2017,38(10):1304-1310. |
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| 作者姓名： | 姜贵先 罗溪 张露露 刘青 肖良 |
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| 作者单位： | 1. 第二军医大学学员旅学员2队,上海,200433;2. 第二军医大学学员旅学员8队,上海,200433;3. 山西农业大学动物科技学院,晋中,030801;4. 第二军医大学海军医学系海洋生物技术教研室,上海,200433 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金（81470518），上海市浦江人才项目（16PJ1411000）. |
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| 摘 要： | 长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)的保守性表现在一级结构、空间结构、转录位置、剪接模式及组织分布等方面,是目前lncRNA研究的热点和难点.不断深入的lncRNA保守性研究可应用于参考基因组相对匮乏的非模式生物lncRNA的筛选过程,并且极大地提升了非模式生物lncRNA数据库建立的完整性和准确性.借助针对开放阅读框长度、密码子分布与出现频率、功能性结构域等保守信息开发而来的lncRNA筛选工具或流程如CPC、PLAR(pipeline for lncRNA annotation from RNA-seq data)等,已成为目前非模式生物lncRNA的筛选及其参考数据库构建的新策略.本文就lncRNA的保守性及其在非模式生物lncRNA筛选中的应用作一综述,并简要介绍了一种运用其保守性的筛选方法——PLAR.
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| 关 键 词： | 长链非编码RNA 保守性 非模式生物 筛选 |
| 收稿时间： | 2017/5/30 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2017/9/11 0:00:00 |
Conservation of long noncoding RNA and its application in screening long noncoding RNA in non-model organisms |
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| JIANG Gui-xian,LUO Xi,ZHANG Lu-lu,LIU Qing and XIAO Liang.Conservation of long noncoding RNA and its application in screening long noncoding RNA in non-model organisms[J].Academic Journal of Second Military Medical University,2017,38(10):1304-1310. |
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| Authors: | JIANG Gui-xian LUO Xi ZHANG Lu-lu LIU Qing and XIAO Liang |
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| Institution: | 1. The Second Student Team, Student Brigade, Second Military Medical University, Shanghai 200433, China;2. The Eighth Student Team, Student Brigade, Second Military Medical University, Shanghai 200433, China;3. College of Animal and Technology, Shanxi Agricultural University, Jinzhong 030801, Shanxi, China;4. Department of Marine Biotechnology, Faculty of Naval Medicine, Second Military Medical University, Shanghai 200433, China*Corresponding author |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | long noncoding RNA conservation non-model organisms screening |
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