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基于离子通道相关基因的膀胱癌患者预后风险评估模型构建
引用本文:张殿锋,殷桂草,郑生旗,陈遒,李一帆.基于离子通道相关基因的膀胱癌患者预后风险评估模型构建[J].浙江大学学报(医学版),2023(4):499-509.
作者姓名:张殿锋  殷桂草  郑生旗  陈遒  李一帆
作者单位:1. 河南省许昌市中心医院泌尿外科;2. 扬州大学附属医院泌尿外科
基金项目:国家自然科学基金(82002675);;江苏省科技计划青年基金(BK2020938);;扬州市软科学研究计划(YZ2022267);;江苏省博士后研究资助计划(2020Z268);
摘    要:目的:基于离子通道相关基因(ICRG)构建膀胱癌患者预后风险评估模型。方法:首先从已有研究中获得ICRG。患者临床信息和信使RNA表达均从癌症基因组图谱数据库膀胱癌数据集下载。接着,采用Cox回归分析和最小绝对收缩与选择算子回归分析筛选预后相关基因并通过免疫组织化学及定量逆转录量聚合酶链反应结果验证相关基因的表达。然后,构建预测膀胱癌患者预后的风险评分方程并根据风险评分的中位数将患者分为高风险组和低风险组,比较两组免疫细胞浸润丰度差异。应用Kaplan-Meier生存曲线及应用受试者操作特征曲线(ROC曲线)评估风险评分方程的准确性以及临床应用价值。最后,通过单因素和多因素Cox回归筛选与膀胱癌患者预后相关的影响因素构建膀胱癌患者预后的列线图。结果:通过比较膀胱癌组织与健康膀胱组织中ICRG的表达水平,发现共有73个ICRG差异表达,其中11个与膀胱癌患者的预后相关。Kaplan-Meier生存曲线结果提示,基于这11个基因构建的风险评分与患者预后呈负相关;随时间变化的ROC曲线结果显示,风险评分预测患者1、3、5年预后的曲线下面积分别为0.634、0.665、0.712。分层分析发现...

关 键 词:膀胱癌  离子通道  基因  预后  风险评估
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