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实时荧光定量PCR直接检测粪便标本艰难梭菌tcdB基因
引用本文:谢乐,许雨乔,刘成成,夏文颖,孙鹏飞,梅亚宁,崔仑标,刘根焰.实时荧光定量PCR直接检测粪便标本艰难梭菌tcdB基因[J].临床检验杂志,2016(3):211-214.
作者姓名:谢乐  许雨乔  刘成成  夏文颖  孙鹏飞  梅亚宁  崔仑标  刘根焰
作者单位:南京医科大学第一附属医院检验学部,南京 210029,南京医科大学第一附属医院检验学部,南京 210029,南京医科大学第一附属医院检验学部,南京 210029,南京医科大学第一附属医院检验学部,南京 210029,南京医科大学第一附属医院检验学部,南京 210029,南京医科大学第一附属医院检验学部,南京 210029,江苏省疾病预防控制中心卫生部肠道病重点实验室,南京 210009,南京医科大学第一附属医院检验学部,南京 210029
基金项目:卫生部肠道病重点实验室(EM201401);江苏省“兴卫工程”实验诊断学重点实验室(XK201114)。
摘    要:目的建立艰难梭菌实时荧光定量PCR检测方法,直接检测粪便标本艰难梭菌tcd B基因,并探讨其应用价值。方法根据艰难梭菌基因组设计tcd B基因特异性引物及探针,用ATCC 43255标准株评价其敏感性,选取艰难梭菌生物学特征相近的临床菌株验证其特异性;收集2015年10-12月临床腹泻患者稀便标本115份,提取基因组总DNA后进行tcd B基因检测,并以产毒培养法为参考方法,探讨该方法的临床诊断价值。结果荧光定量PCR法最低检测限为1×10-3ng,并且仅特异性地扩增产毒艰难梭菌;临床样本评价荧光定量PCR的敏感性、特异性、阳性预测值和阴性预测值分别为75.0%、99.1%、85.7%和98.1%。结论实时荧光定量PCR直接检测稀便标本中的艰难梭菌tcd B基因可用于艰难梭菌相关腹泻的快速诊断。

关 键 词:艰难梭菌  tcdB  实时荧光定量PCR  产毒培养
收稿时间:2016/1/13 0:00:00

Direct detection of Clostridium difficile tcdB gene by real time fluorescence quantitative PCR
Abstract:
Keywords:Clostridium difficile  tcdB  real-time fluorescence quantitative PCR  toxigenic culture
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