结核分枝杆菌Rv3529c蛋白的生信分析及原核表达

目的 通过生物信息学软件预测结核分枝杆菌Rv3529c基因编码蛋白的结构和功能，并对其进行原核表达。 方法 利用UniproKB数据库、PredictProtein服务、AlphaFold系统、SWISS -MODEL服务、ProtParam蛋白分析工具、ProtScale、DeepTMHMM服务和SignalP-5.0服务、ProtCompB方法、IEDB数据库和STRING数据库等生物信息学预测软件对Rv3529c编码蛋白的二级和三级结构、理化性质、疏水性、信号肽、跨膜区、亚细胞定位及免疫表位进行分析预测。利用分子克隆技术构建表达质粒载体pET-32a-Rv3529c并进行原核表达，运用UniprotKB数据库的Blast工具对氨基酸序列进行比对，采用MEGA 11软件构建进化树，进行系统进化分析，运用STRING数据库分析蛋白间相互作用。 结果 Rv3529c基因全长1 155 bp，共编码384个氨基酸。Rv3529c基因编码蛋白分子量为43.35 kDa，等电点为6.04，二级结构以α-螺旋为主，该蛋白为稳定的亲水性蛋白，无跨膜区、无信号肽，预测该蛋白亚细胞定位在细胞质中或细胞膜上，存在多个抗原抗体表位，与多个蛋白质有相互作用。经克隆、表达、鉴定、纯化后获得浓度和纯度较高的Rv3529c蛋白。 结论 成功克隆、表达、纯化结核分枝杆菌Rv3529c蛋白，并初步预测其结构及功能。

Bioinformatics analysis and prokaryotic expression of the protein Rv3529c of Mycobacterium tuberculosis