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基于全基因组分析的肺炎克雷伯菌耐药性与流行病学特征分析
作者姓名:熊流新  黄志伟  钟建辉  陆丽苗  梁启兰  潘朝勇  李淑英  苏乐斌
作者单位:肇庆市第二人民医院检验科;肇庆市第二人民医院重症监护室;肇庆市疾病预防控制中心微生物检验科
基金项目:肇庆市科技创新指导类项目(2021040314020)
摘    要:目的 了解肇庆市第二人民医院肺炎患者肺炎克雷伯菌(KP)分离株和医院环境KP分离株的病原学和分子流行病学特征。方法 对该医院2021年收集的49株肺炎患者KP分离株和2株医院环境KP分离株进行抗菌药物敏感性试验鉴定其耐药表型;全基因组测序确定其质粒、分子血清型、多位点序列分型(MLST)、毒力基因与耐药基因等分子特征;基于core-SNPs构建发育进化树,分析优势流行型菌株的进化特征。结果 感染KP的肺炎病患者大部分有基础病(87.76%),年龄>50岁(89.80%)。51株KP耐药表型以耐碳青霉烯肺炎克雷伯菌(CRKP)为主,存在优势耐药谱。携带的质粒主要为IncR、IncFⅡ(pHN7A8)和ColRNAⅠ,且IncFⅡ(pHN7A8)的pMLST为F33:A-:B-型。拥有优势分子血清型和MLST的菌株与优势耐药表型的菌株完全重合,为O2aK64-ST11 CRKP株。毒力基因和耐药基因显示,51株KP中2株菌株携带脲酶基因ureB。全部菌株携带耐药基因情况严重,且检测出10种不同亚型的β-内酰胺酶基因家族(blaCT...

关 键 词:肺炎克雷伯菌  医院内感染  毒力基因  耐药基因
收稿时间:2022-04-19
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