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基于网络药理学和分子对接法研究六堡茶干预COVID-19的活性成分
引用本文:周丹水,陈小雪,吴志敏,倪维鞠,邱瑞瑾,于翠平,蓝伦礼,王颖芳,陈守登,曾宇. 基于网络药理学和分子对接法研究六堡茶干预COVID-19的活性成分[J]. 中国药科大学学报, 2020, 51(5): 556-567
作者姓名:周丹水  陈小雪  吴志敏  倪维鞠  邱瑞瑾  于翠平  蓝伦礼  王颖芳  陈守登  曾宇
作者单位:广东药科大学中药学院,广州 510006,中山大学附属第五医院广东省生物医学影像重点实验室,珠海 519000,广东药科大学中药学院,广州 510006,广东药科大学中药学院,广州 510006,梧州市农业科学研究所,梧州市六堡茶研究院,梧州 543002,梧州市农业科学研究所,梧州市六堡茶研究院,梧州 543002,桂林医学院药学院,桂林 541199,广东药科大学中药学院,广州 510006,中山大学附属第五医院广东省生物医学影像重点实验室,珠海 519000,广东药科大学中药学院,广州 510006
基金项目:广西重点研发计划资助项目(No.AB1850019)
摘    要:
采用网络药理学和分子对接法探究六堡茶干预COVID-19的物质基础和作用机制。通过文献与中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP)等数据库,检索得到六堡茶的化学成分并对其进行筛选得到六堡茶活性成分及对应靶标,并将对应靶标导入Uniprot数据库中进行基因名的校正,运用Cytoscape 3.7.1软件构建"六堡茶-成分-靶标"网络。通过GeneCards数据库对COVID-19疾病靶点进行预测。将六堡茶与疾病的靶标进行映射,采用STRING数据库分析靶标蛋白的互作关系,从中筛选出核心靶标并运用DAVID等数据库对核心靶标进行GO(gene ontology)富集分析和KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes)通路富集分析。最后将筛选出来的活性成分与受体蛋白SARS-CoV-2 3CL水解酶(Mpro)进行分子对接。筛选得到6种六堡茶活性成分,分别是(+)-儿茶素、(-)-表没食子儿茶素没食子酸酯(EGCG)、α-菠甾醇、(-)-儿茶素没食子酸酯、角鲨烯和氯化天竺葵素,对应作用靶标156个。其中与COVID-19的共同靶标112个,核心靶标...

关 键 词:六堡茶  COVID-19  网络药理学  分子对接  SARS-CoV-2 3CL水解酶
收稿时间:2020-04-17
修稿时间:2020-05-22

Potential active compounds of Liupao tea for prevention and treatment of COVID-19 based on network pharmacology and molecular docking
ZHOU Danshui,CHEN Xiaoxue,WU Zhimin,NI Weiju,QIU Ruijin,YU Cuiping,LAN Lunli,WANG Yingfang,CHEN Shoudeng and ZENG Yu. Potential active compounds of Liupao tea for prevention and treatment of COVID-19 based on network pharmacology and molecular docking[J]. Journal of China Pharmaceutical University, 2020, 51(5): 556-567
Authors:ZHOU Danshui  CHEN Xiaoxue  WU Zhimin  NI Weiju  QIU Ruijin  YU Cuiping  LAN Lunli  WANG Yingfang  CHEN Shoudeng  ZENG Yu
Abstract:
Keywords:Liupao tea  COVID-19  network pharmacology  molecular docking  SARS-CoV-2 3CL hydrolase
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