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毛乳头细胞凝聚性生长差异表达基因的筛选及HSPC016全长克隆的生物信息学分析
引用本文:Wang JW,Song ZQ,Yang XC,Mai Y,Hao F. 毛乳头细胞凝聚性生长差异表达基因的筛选及HSPC016全长克隆的生物信息学分析[J]. 中华医学杂志, 2004, 84(18): 1513-1517
作者姓名:Wang JW  Song ZQ  Yang XC  Mai Y  Hao F
作者单位:400038,重庆,第三军医大学西南医院皮肤科
基金项目:国家自然科学基金资助项目 (3 0 2 0 0 2 49)
摘    要:
目的 筛选与毛乳头细胞 (DPC)凝聚性生长相关的基因表达 ,全长克隆凝聚性生长相关基因HSPC0 16并进行生物信息学分析。方法 应用抑制性消减杂交技术 ,构建DPC凝聚性生长与非凝聚性生长的cDNA消减文库 ,克隆鉴定凝聚性生长特异表达基因。应用RACE技术 ,克隆DPC凝聚性状态下HSPC0 16全长表达序列 ,使用生物信息学手段分析其染色体定位、蛋白序列、结构域及功能。结果 成功构建了DPC凝聚性生长差异表达cDNA文库 ,筛选出DPC与细胞同源凝集、生长调控、分化发育及信号转导相关的基因 ,其中包括HSPC0 16。HSPC0 16全长cDNA为 4 0 0bp ,染色体定位于 3q2 1 31;HSPC0 16蛋白为 6 4aa,结构域属于PD0 5 3992家族 ,与T2FA基因功能域同源。结论DPC凝聚性生长的差异表达cDNA文库为进一步筛选并克隆DPC凝聚性生长相关基因奠定了基础 ,也为宏观分析多基因协同参与DPC生长调控和功能发挥提供了依据。HSPC0 16的生物信息学分析显示此基因与DPC基因转录调节有关

关 键 词:HSPC 生物信息学分析 毛乳头细胞 克隆 基因 筛选 表达 生长差异 DPC 染色体定位

Gene screening of dermal papilla cells in the state of aggregative growth and full-length cloning of HSPC016 gene for bioinformatics
Wang Ji-Wen,Song Zhi-Qiang,Yang Xi-Chuan,Mai Yue,Hao Fei. Gene screening of dermal papilla cells in the state of aggregative growth and full-length cloning of HSPC016 gene for bioinformatics[J]. Zhonghua yi xue za zhi, 2004, 84(18): 1513-1517
Authors:Wang Ji-Wen  Song Zhi-Qiang  Yang Xi-Chuan  Mai Yue  Hao Fei
Affiliation:Department of Dermatology, Southwest Hospital, Third Military Medical University, Chongqing 400038, China.
Abstract:
Keywords:Dermal papilla cells  Suppression subtractive hybridization  HSPC016  Bioinformatics
本文献已被 CNKI 万方数据 PubMed 等数据库收录!
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