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| IFITM1克隆测序及生物信息学分析 | |
| 引用本文： | 刘宇虎,钟东,柳娟,杨兴龙,张振书,肖冰,郭文英. IFITM1克隆测序及生物信息学分析[J]. 医学研究杂志, 2009, 38(5) |
| 作者姓名： | 刘宇虎 钟东 柳娟 杨兴龙 张振书 肖冰 郭文英 |
| 作者单位： | 1. 广东省东莞市人民医院消化科,523018 2. 南方医科大学南方医院消化病研究所,广州,510515 |
| 基金项目： | 国家自然科学基金，广东省医学科学研究基金，东莞市科技计划项目 |
| 摘 要： | 目的 研究干扰素诱导的跨膜蛋白-1基因(interferon induced transmembrane protein 1.IFITM1)克隆、测序,对序列进行分析,并获取生物学信息.方法 以IFITM1的cDNA为模板,用Pfu酶做PCR扩增,在EcoRⅠ和Hind Ⅲ双酶切后,将IFITM1的cDNA片段克隆到pUCm-T质粒,对重组的pUCm-T-IFITM1测序后,采用All GenBank+EMBL+DDBJ+PDB Sequences Database 和 Simple Modular Architecture Research Tool (SMART)对IFITM1的cDNA进行生物信息学分析. 结果扩增后,含有IFITM1基因cDNA的PCR产物约1000 bp,IFITM1的 cDNA成功克隆到pUCm-T质粒并进行测序.序列分析结果显示,IFITM1结构cDNA全长683bp, 有2个外显子.IFITM1的 mRNA编码的氨基酸在37～57和87～107有2个跨膜区,编码125个氨基酸的多肽,其蛋白相对分子质量为14kDa.结论 IFITM1基因的成功扩增、克隆、测序,获取了IFITM1基因的cDNA、mRNA以及编码蛋白质氨基酸的生物学信息,有利于研究IFITM1基因与大肠癌的关系. |
| 关 键 词： | 结直肠癌 干扰素诱导的跨膜蛋白-1(IFITM1) 基因克隆 序列分析 生物信息 |
The Cloning and Sequence Analysis of Interferon Induced Transmembrane Protein 1 Gene |
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| Liu Yuhu,Zhong Dong,Liu Juan,Yang Xinglong,Zhang Zhenshu,Xiao Bing,Guo Wenying. The Cloning and Sequence Analysis of Interferon Induced Transmembrane Protein 1 Gene[J]. Journal of Medical Research, 2009, 38(5) | |
| Authors: | Liu Yuhu Zhong Dong Liu Juan Yang Xinglong Zhang Zhenshu Xiao Bing Guo Wenying |
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