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基于网络药理学-分子对接研究益气逐淤汤针对胃癌的作用机制
引用本文:张颖,邱汉波,侯恩存,覃凤飞,郭东霖,周尧红,赵艺蔓,郑景辉.基于网络药理学-分子对接研究益气逐淤汤针对胃癌的作用机制[J].世界中医药,2021(23).
作者姓名:张颖  邱汉波  侯恩存  覃凤飞  郭东霖  周尧红  赵艺蔓  郑景辉
作者单位:广西中医药大学附属瑞康医院,南宁,530000
基金项目:北京医卫健康公益基金会医学科学研究基金项目(YWJKJJHKYJJ-F3208D)——安罗替尼口服联合以雷替曲塞作为灌注药物的TACE治疗中晚期肝癌的研究
摘    要:目的:通过网络药理学-分子对接方法研究益气逐瘀汤针对胃癌的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、中医百科全书数据库(ETCM)获得益气逐瘀汤所有药物的化学成分和作用的有关靶点,通过GeneCards、OMIM、GEO数据库筛选出胃癌的靶点,通过运用R语言取交集进行维恩分析,对得到的靶点导入Cytoscape 3.7.2软件中,构建活性成分靶点网络,并将其导入String数据库,构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,并利用Cytoscape 3.7.2中的Bisogenet插件进行网络拓扑分析。同时运用R语言Bioconductor平台对益气逐瘀汤治疗胃癌的潜在靶点进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析,并将结果导入Cytoscape 3.7.2软件中绘图,得到KEGG网络关系图。运用分子对接软件Autodock vina,将核心靶点与活性成分对接,最后用Plmoy绘制图片。结果:共得到216个化学成分和1 105疾病靶点,其中交集靶点38个。关键靶点包括IL-6、MMP9、PTGS2.GO功能分析主要与脂多糖的表达,氧化酶还原活性等有关。KEGG分析显示益气逐瘀汤治疗胃癌主要是通过IL-17、TNF、核因子κB、TLR和癌症相关信号通路发挥作用。分子对接结果显示与MMP9结合性能最好。结论:益气逐瘀汤治疗胃癌是通过多成分、多靶点来发挥作用,为进一步研究其作用机制奠定了基础。

关 键 词:网络药理学  分子对接  益气逐瘀汤  胃癌  作用通路  靶点  作用机制  信号通路
收稿时间:2020/5/25 0:00:00

Research of the Mechanism of Yiqi Zhuyu Decoction in the Treatment of Advanced Gastric Cancer Based on Network Pharmacology and Molecular Docking
ZHANG Ying,QIU Hanbo,HOU Encun,QIN Fengfei,GUO Donglin,ZHOU Yaohong,ZHAO Yiman,Zheng Jinghui.Research of the Mechanism of Yiqi Zhuyu Decoction in the Treatment of Advanced Gastric Cancer Based on Network Pharmacology and Molecular Docking[J].World Chinese Medicine,2021(23).
Authors:ZHANG Ying  QIU Hanbo  HOU Encun  QIN Fengfei  GUO Donglin  ZHOU Yaohong  ZHAO Yiman  Zheng Jinghui
Institution:Ruikang Hospital,Guangxi University of Traditional Chinese Medicine,Nanning 530000,China
Abstract:
Keywords:Network pharmacology  Molecular docking  Yiqi Zhuyu Decoction  Gastric cancer  Pathway of action  Target  Mechanism of action  Signal pathway
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