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高通量测序分析乳腺癌微生物群落特征题录
作者姓名:常靖  杨慧  李想  李永  杨淑敏  夏庆欣  张贺
作者单位:1. 郑州大学附属肿瘤医院/河南省肿瘤医院医务部;2. 西北工业大学生命学院;3. 郑州大学附属肿瘤医院/河南省肿瘤医院乳腺科;4. 郑州大学附属肿瘤医院/河南省肿瘤医院病理科
基金项目:河南省科技厅科技攻关(232102310093);
摘    要:目的分析乳腺癌患者肿瘤组织与癌旁组织微生物菌群多样性, 筛选乳腺癌患者肿瘤组织中的特异性细菌。方法分析2021年2月至9月河南省肿瘤医院行乳腺癌根治术切除的20例乳腺癌患者的肿瘤组织(TT组)与配对瘤旁组织(TN组), 采用Illumina HiSeq高通量测序技术对乳腺癌患者组织样本进行细菌V3-V4区的16S rDNA测序及生物信息学分析, 采用t检验进行计数资料比较。结果在门水平上, TT组与TN组的微生物菌群主要由变形菌门、放线菌门、厚壁菌门和拟杆菌门组成, 累计含量>60%。微生物多样性分析显示, Chao1指数TN组比TT组为10 167.59±2 929.38比9 044.89±2 735.11(t=1.09, P>0.05), Ace指数TN组比TT组为12 571.96±2 859.65比11 704.53±2 855.75(t=0.81, P>0.05)。Beta多样性显示两组菌群结构差异有统计学意义(R=0.27, P<0.001)。门水平差异分析显示, 变形菌门(TN组比TT组为42.63±16.76比52.08±9.53, t=-0.6...

关 键 词:肿瘤微生物  16S rDNA  乳腺癌  多样性
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