筛选与探讨乳腺癌的关键生物标志物及预后价值 |
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作者姓名: | 王欢 沈平 宋哲瑶 王星云 姜莹 崔荣军 |
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作者单位: | 牡丹江医学院生物化学与分子生物学教研室,黑龙江 牡丹江 157011;中国人民解放军联勤保障部队第九六一医院检验病理输血科,黑龙江 齐齐哈尔 161000;牡丹江医学院生物化学与分子生物学教研室,黑龙江 牡丹江 157011 |
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基金项目: | 牡丹江医学院博士启动基金项目 |
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摘 要: | 目的 基于生物信息学方法筛选乳腺癌的关键生物标志物,并分析其预后价值。方法 利用TCGA和GEO数据库筛选乳腺癌的共有差异表达基因;DAVID数据库对差异基因进行GO和KEGG富集分析;单因素和多因素Cox分析获得具有显著预后价值的基因;利用UALCAN在线工具对关键基因进行病理特征分析。结果 从TCGA和GEO数据库中分别获得1566和231个差异基因;通过共表达分析得到140个共有的差异表达基因;单因素和多因素Cox回归分析中发现S100B和TFF1在乳腺癌中具有独立预后价值;临床病理特征分析结果显示,S100B和TFF1在乳腺癌组织中的表达与其患者的性别、分期、淋巴结转移、TP53突变等均有显著差异。结论 S100B和TFF1可作为关键生物标志物影响乳腺癌的发生和发展。
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关 键 词: | 乳腺癌 TCGA GEO 生物标志物 生物信息学 |
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