戊型肝炎病毒基因分型研究进展

戊型肝炎病毒(hepatitis E virus, HEV)是引起急性或慢性病毒性肝炎的一种常见病原体,一般情况下自限性感染,症状较轻。HEV的遗传变异和不断进化有助于其对新宿主的适应,并导致发病机制的改变。准确且统一的基因分型标准对HEV的基础研究以及戊型肝炎的临床治疗和预防都有着重要的意义。目前,基于开放阅读框(open reading frame, ORF)1和ORF2的系统发育和氨基酸距离分析(部分毒株需要全基因组序列)可将HEV分为8种基因型和36种基因亚型。由于HEV不同基因型或基因亚型的鉴定标准尚未严格统一,因此还有未被分类到亚型的毒株。本研究对HEV的基因组结构和功能、基因分型的标准、在线基因分型工具及跨物种传播进行综述。