全基因组表达谱芯片在新疆维汉族胶质母细胞瘤患者中的应用研究 |
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作者姓名: | 刘亮 栾新平 夏海成 顿志平 朱正权 杜山别克 李文婷 |
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作者单位: | 1. 新疆医科大学附属肿瘤医院 乌鲁木齐 830011 2. 新疆医科大学第二附属医院 乌鲁木齐 830063 3. 山东大学第二医院 济南 250033 |
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基金项目: | 新疆医科大学创新基金项目编号XJC201271 |
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摘 要: | 目的:运用基因表达谱芯片,筛选有意义的新疆维、汉族患者胶质母细胞瘤的差异表达基因,从而探讨差异基因在新疆维、汉族患者胶质母细胞瘤发病机制及预后转归中的作用及临床意义。方法运用全基因组表达谱芯片检测3例维族患者胶质母细胞瘤、3例汉族患者胶质母细胞瘤的基因表达情况,并通过GenomeStudio软件,R语言lumi包进行标准化处理筛选差异表达基因(P<0.05);运用Web Gestalt软件,对差异基因做GO生物信息学分析(P<0.05)。结果维、汉族患者胶质母细胞瘤全基因组表达谱的比较分析发现,筛选出显著差异表达的基因共1475个,上调669个,下调807个(其中1个基因(STRC)对应2个转录本,1个转录本表达上调1个转录本表达下调),差异基因中通过GO分析有1175个关键基因分布在小G T P酶调节信号通路、Ras信号通路、神经元反应蛋白调节、中枢神经系统髓鞘形成等多个生物学过程的功能节点中。结论通过对维、汉族患者胶质母细胞瘤基因表达谱的研究,筛选出差异表达的相关基因,并对其功能及定位信息进一步分析,从多基因相互作用的角度探究胶质母细胞瘤发生发展分子机制及维、汉族胶质母细胞瘤的发病机制差异性。
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关 键 词: | 胶质母细胞瘤 民族 基因表达谱 生物功能 |
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