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核心蛋白和非结构蛋白5B 直接测序法对丙型肝炎病毒基因分型的影响
引用本文:李威,宁会彬,康谊,靳秀,刘俊平,尚佳. 核心蛋白和非结构蛋白5B 直接测序法对丙型肝炎病毒基因分型的影响[J]. 中华传染病杂志, 2015, 0(6)
作者姓名:李威  宁会彬  康谊  靳秀  刘俊平  尚佳
作者单位:河南省人民医院感染性疾病科, 郑州,450003
基金项目:国家临床重点专科建设项目(2013年度);河南省医学科技攻关计划普通项目(201003107);河南省医学科技攻关计划省部共建项目
摘    要:
目的:分析 HCV 核心蛋白(Core)和非结构蛋白(NS)5B 区直接测序的敏感性和准确性。方法收集慢性丙型肝炎患者血清51份,采用反转录 PCR 对 Core 和 NS5B 区分别扩增,产物直接测序,构建进化树进行基因分型。结果51份样本中,Core 区扩增阳性49份,占96.1%。共检出5种基因亚型:1b 为61.2%(30/49),2a 为20.4%(10/49),2b 为2.0%(1/49),3a 为4.1%(2/49),6a 为12.2%(6/49)。NS5B 区扩增阳性45份,占88.2%。1b、2a、2b、3a、6a 分别占62.2%(28/45)、20.0%(9/45)、2.2%(1/45)、4.4%(2/45)和11.1%(5/45)。结论与 NS5B 区相比,Core 区引物设计容易,扩增效率和分型成功率较高,可作为 HCV 基因型流行病学调查和临床研究的优先选择。

关 键 词:肝炎病毒属  基因型  病毒核心蛋白质类  非结构蛋白 5B

Impact of directly sequenced core and non-structrural protein 5B regions on hepatitis C virus genotyping
Li Wei,Ning Huibin,Kang Yi,Jin Xiu,Liu Junping,Shang Jia. Impact of directly sequenced core and non-structrural protein 5B regions on hepatitis C virus genotyping[J]. Chinese Journal of Infectious Diseases, 2015, 0(6)
Authors:Li Wei  Ning Huibin  Kang Yi  Jin Xiu  Liu Junping  Shang Jia
Abstract:
Keywords:Hepacivirus  Genotype  Viral core proteins  NS5B
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