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共调控共互作蛋白结构域的特征研究
引用本文:刘永宾,高磊,李冬果,李霞. 共调控共互作蛋白结构域的特征研究[J]. 中国优生与遗传杂志, 2010, 0(3): 18-21
作者姓名:刘永宾  高磊  李冬果  李霞
作者单位:首都医科大学生物医学工程学院;哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院;
基金项目:国家自然基金(批准号:30871394、30370798、30571034); 国家863项目(批准号:2007AA02Z329); 黑龙江科技攻关项目(批准号:ZJG0501、1055HG009、GB03C602-4、BMFH060044)
摘    要:目的研究在共调控蛋白、共互作蛋白、及同时存在共调控与共互作关系的蛋白中所包含结构域的分布特征。方法利用转录调控数据、蛋白互作数据和蛋白结构域数据,以聚集系数为测度,研究结构域在共调控集合、共互作集合以及共调控且共互作的集合中的聚集特征,并通过随机实验验证聚集特征的显著性。结果共调控集合、共互作集合以及共调控且共互作集合的聚集系数显著较高,具有显著性(P〈0.01)。结论研究表明,共调控集合、共互作集合、共调控且共互作集合更倾向于含有相同的结构域。

关 键 词:共调控  共互作  结构域特征  聚集系数

Research on domain features combinate of co-regulation and co-interaction.
LIU Yong-bin,GAO Lei,LI Dong-guo,LI Xia,.. Research on domain features combinate of co-regulation and co-interaction.[J]. Chinese Journal of Birth Health & Heredity, 2010, 0(3): 18-21
Authors:LIU Yong-bin  GAO Lei  LI Dong-guo  LI Xia  .
Affiliation:LIU Yong-bin1,GAO Lei1,LI Dong-guo1,LI Xia1,2.(1.Biomedical Engineering College of Capital Medical University,Beijing 100069,2.College of Bioinformatics Science , Technology,Harbin Medical University,Harbin 150081)
Abstract:Objective:Reserch on the distributing features of domains which are included in the proteins set,the proteins set are co-regulate,co-interaction or co-regulate and co-interaction.Methods:The characteristics of domain in co-regulation protein set,co-interaction protein set and co-regulation & co-interacton protein set are evaluated by aggregation factor,and verify significant of the aggregation factor through random experiment.Results:Aggregation factors are significance(P<0.01) in the co-regulation dataset,...
Keywords:Co-regulation  Co-interaction  Domain features  Aggregation factor  
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