| 胎儿弯曲菌龟亚种中国分离株的种群结构、毒力基因及耐药性分析题录 |
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| 引用本文： | 陈富,陈燕,陈晓慰,李启伟,许振杰,陈茶,李顺光,屈平华,李松.胎儿弯曲菌龟亚种中国分离株的种群结构、毒力基因及耐药性分析题录[J].中华微生物学和免疫学杂志,2023(8). |
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| 作者姓名： | 陈富 陈燕 陈晓慰 李启伟 许振杰 陈茶 李顺光 屈平华 李松 |
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| 作者单位： | 1. 广州市番禺区健康管理中心;2. 广州中医药大学第二临床医学院;3. 广州中医药大学第二临床医学院/广东省中医院检验医学部 |
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| 基金项目： | 广东省基础与应用基础科学基金(2021A1515110857)； |
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| 摘 要： | 目的了解胎儿弯曲菌龟亚种(Campylobacter fetus subsp.testudinum, Cft)的分子流行病学特征。方法对本实验室2010—2022年收集的15株胎儿弯曲菌龟亚种进行全基因组测序, 结合GenBank公布的全球Cft基因组数据进行流行病学分析;MLST-GrapeTree分析Cft的群体遗传结构;核心基因组单核苷酸多态性位点(cgSNP)构建Cft的系统发育树, rhierBAPS确定其种群结构;CARD、ResFinder及VFDB注释Cft的耐药及毒力基因;E-test法进行药敏试验, 并参考CLSI-M45空肠/大肠弯曲菌药敏标准进行结果解释。结果基于基因组平均核苷酸一致性(ANI)分析, 共纳入全球41株Cft基因组信息, 其中人类来源24株, 动物来源13株, 未知来源4株。流行病学资料显示, 24株人类来源菌株中, 20株感染对象为黄种人, 1例为白种人(配偶是亚裔), 其余未知, 差异分布具有统计学意义。13株动物来源菌株均分离自爬行动物, 包括龟类6株、蛇类4株、蜥蜴类3株。MLST分型显示, 中国分离株以ST46为主要序列型, 美国则以S...
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| 关 键 词： | 基因组测序分型 分子流行病学 毒力基因 |
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