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ITGA2基因在胰腺癌中表达和临床意义的生物信息学分析
引用本文:贾宇,陈彦,张瑞东,刘建生.ITGA2基因在胰腺癌中表达和临床意义的生物信息学分析[J].重庆医科大学学报,2022,47(12):1485-1489.
作者姓名:贾宇  陈彦  张瑞东  刘建生
作者单位:1. 山西医科大学第一临床医学院,太原 030001
摘    要:目的: 通过生物信息学方法研究ITGA2(integrin alpha-2)基因在胰腺癌中的表达情况、表达与预后的关系、表达与临床病理特征的关系,并进一步预测ITGA2的生物学功能。方法: 使用GEPIA在线工具分析肿瘤基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)中ITGA2基因在胰腺癌组织和正常组织中的表达差异,并回顾性分析表达水平与生存预后的关系。利用LinkedOmics数据库筛选ITGA2在胰腺癌中的共表达基因列表,在WebGestalt数据库中分析生物学功能。下载TCGA数据库中胰腺癌患者临床信息和ITGA2表达数据,分析ITGA2表达量与临床病理特征的关系,研究影响胰腺癌生存预后的危险因素。结果: ITGA2在胰腺癌组织中显著高表达(P<0.05);与低表达患者相比,ITGA2高表达的胰腺癌患者的总体生存期(log-rank P=0.002)、无病生存期(log-rank P=0.004)明显降低。利用LinkedOmics找出278个与ITGA2共表达的基因,GO分析显示这些基因主要参与细胞黏附、细胞间连接组成、细胞骨架形成等生物过程;KEGG分析显示显著富集于黏着斑、黏附连接、紧密连接、肌动蛋白细胞骨架的调节、肿瘤蛋白聚糖等通路。ITGA2表达水平与肿瘤分期(χ2=6.380,P=0.036)、肿瘤大小或侵袭范围(χ2=5.214,P=0.022)、肿瘤分化程度(χ2=11.998,P=0.002)显著相关具有统计学意义。Cox回归分析结果显示,ITGA2表达水平是影响胰腺癌患者预后的独立危险因素(HR=1.888,95%CI=1.021~3.490,P=0.043)。结论: ITGA2基因与胰腺癌发生发展密切相关,可作为临床判定胰腺癌预后的标志物,并有成为肿瘤治疗靶点的潜力。

关 键 词:胰腺癌  整合素α2  基因表达  生存分析  信号通路
收稿时间:2020/7/21 0:00:00

Bioinformatics analysis of the expression and clinical significance of ITGA2 gene in pancreatic adenocarcinoma
Jia Yu,Chen Yan,Zhang Ruidong,Liu Jiansheng.Bioinformatics analysis of the expression and clinical significance of ITGA2 gene in pancreatic adenocarcinoma[J].Journal of Chongqing Medical University,2022,47(12):1485-1489.
Authors:Jia Yu  Chen Yan  Zhang Ruidong  Liu Jiansheng
Institution:1. The First Clinical Medical College, Shanxi Medical University
Abstract:
Keywords:
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