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不同种源银柴胡及其伪品的ITS2序列分析与鉴别
引用本文:李振凯,冯璐,杨燕,宋乐,王红,李彦青,高跳,彭励. 不同种源银柴胡及其伪品的ITS2序列分析与鉴别[J]. 中国现代中药, 2022, 24(12): 2335-2341
作者姓名:李振凯  冯璐  杨燕  宋乐  王红  李彦青  高跳  彭励
作者单位:宁夏大学 生命科学学院,宁夏 银川 750021
基金项目:宁夏回族自治区自然科学基金项目(2021AAC03103);吴忠市科技创新驱动计划项目;吴忠市同心县科技发展计划项目
摘    要:目的:采用基于内转录间隔区2 (ITS2)序列的分子鉴定法分别对17份不同种源银柴胡和6种伪品基原植物进行分析和鉴别。方法:对植物样品进行DNA提取、扩增、测序,并检索GenBank数据库,获取17份不同种源银柴胡及6种伪品的ITS2序列。采用ITS2数据库进行注释,去除5.8S和28S片段,获得完整的ITS2序列,利用MEGA 8.0软件进行序列比对、计算K2P遗传距离、构建邻接(NJ)系统发育树,采用美国国家生物技术信息中心(NCBI)数据库和“中药材DNA条形码鉴定系统”进行BLAST分析和物种鉴定,并利用ITS2数据库预测二级结构。结果:17份银柴胡样品共得到3个单倍型ITS2序列(YCH1、YCH2和YCH3),经与银柴胡标准ITS2序列比对,发现YCH1和YCH2与标准序列一致,但YCH3有4处碱基缺失,表现出0.936的遗传距离,在系统发育树中被单独聚为一个分支,并具有不同的二级结构;6种伪品的ITS2序列在长度、鸟嘌呤+胞嘧啶占比、变异位点、遗传距离、NJ系统发育树和二级结构上均与银柴胡ITS2序列表现出明显的差异。结论:基于ITS2序列的分子鉴定方法可以有效鉴别银柴胡...

关 键 词:银柴胡  内转录间隔区2  DNA条形码  种质资源  真伪鉴别
收稿时间:2022-04-11

Identification of Stellariae Radix and Its Counterfeits from Different Provenances Based on ITS2 Sequences
LI Zhen-kai,FENG Lu,YANG Yan,SONG Le,WANG Hong,LI Yan-qing,GAO Tiao,PENG Li. Identification of Stellariae Radix and Its Counterfeits from Different Provenances Based on ITS2 Sequences[J]. Modern Chinese Medicine, 2022, 24(12): 2335-2341
Authors:LI Zhen-kai  FENG Lu  YANG Yan  SONG Le  WANG Hong  LI Yan-qing  GAO Tiao  PENG Li
Affiliation:School of Life Sciences, Ningxia University, Yinchuan 750021, China
Abstract:
Keywords:Stellariae Radix  ITS2  DNA barcode  germplasm resources  identification of authenticity
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