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SRSF6在大鼠胰岛细胞中结合的靶标及测序分析
作者姓名:马艳荣  罗蕴之  马福慧  周忠凯
作者单位:新疆维吾尔自治区人民医院内分泌与代谢病科新疆糖尿病临床医学研究中心
基金项目:新疆维吾尔自治区自然科学基金项目(2021D01C169);
摘    要:
目的 研究富含丝氨酸和精氨酸的剪接因子6(serine and arginine rich splicing factor 6,SRSF6,又称SRp55)作为RNA剪切因子在大鼠胰腺β细胞中对胰岛素分泌影响的具体机制。方法 通过改进的RNA结合蛋白免疫共沉淀高通量测序(improved RNA Binding Protein Immunoprecipitation highthroughput sequencing,iRIP-seq)技术在大鼠胰岛细胞中鉴定SRSF6调控的基因及功能通路,对SRSF6直接作用的靶标和调控通路及可变剪接事件进行鉴定。结果 SRSF6富集性地结合编码区和内含子区域,KEGG分析发现SRSF6结合的靶标在胰岛素信号通路显著富集。结论 SRSF6可能通过与胰岛素通路相关重要基因的m RNA前体结合,调控它们的剪接和加工,进而成为影响胰岛素分泌的潜在因素。

关 键 词:富含丝氨酸和精氨酸的剪接因子6  RNA结合蛋白富集测序  RNA结合蛋白  改进的RNA结合蛋白免疫共沉淀高通量测序
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