Antifungal susceptibility testing practices in mycology laboratories in France, 2018 |
| |
| Institution: | 1. Hôpital Universitaire Jean Minjoz, laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Besançon, France;2. Hospices Civils de Lyon, laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Institut des Agents Infectieux Lyon 1, Lyon, France;3. Hôpital Universitaire Mondor, laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Créteil, France;4. EA Dynamyc UPEC, EnvA, USC Anses, Faculté de Médecine de Créteil, 8, rue du Général Sarrail, 94010 Créteil, France;5. Hôpital Universitaire Bichat, laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Paris, France;6. University Bordeaux, CNRS, Microbiologie Fondamentale et Pathogénicité, UMR 5234, CHU Bordeaux, 33000 Bordeaux, France;7. Service de Parasitologie-mycologie, Hôpital universitaire Bicêtre, APHP, Le Kremlin-Bicêtre, France;8. GQE Le Moulon, INRA, University Paris-Sud/Université ParisSaclay, CNRS, AgroParisTech, Orsay, France;9. Hôpitaux Civils de Colmar, laboratoire de Microbiologie, Colmar, France;10. Hôpital Universitaire Tours, laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Tours, France;11. Hôpital Universitaire Beaujon, laboratoire de Microbiologie, Clichy, France;12. Hôpital Universitaire Caen, laboratoire de Microbiologie, Normandie Univ, UNICAEN, Caen, France;13. Hôpital Universitaire Angers, laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Angers, France;14. Hôpital Universitaire Necker, laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Paris, France;15. Unité Biologie et Pathogénicité Fongiques, Institut Pasteur, 25, rue du Dr Roux, 75015 Paris, France;p. École Vétérinaire de Nantes-ONIRIS, laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Nantes, France;q. Hôpital Universitaire Dupuytren, Centre de biologie et de recherche en santé, laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Limoges, France;r. Hôpital Universitaire Avicenne, laboratoire de Parasitologie-Mycologie, AP-HP, Bobigny, France;s. Hôpital Universitaire Poitiers, laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Inserm U1070, Université de Poitiers, France;t. Centre Hospitalier de Bigorre, laboratoire, Tarbes, France;u. Hôpital Universitaire Toulouse, laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Toulouse, France;v. Hôpital Universitaire Amiens, laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Amiens, France;w. University Grenoble Alpes, CNRS, CHU Grenoble Alpes, INP, TIMC-IMAG, 38000 Grenoble, France;x. Hôpital Universitaire de Rouen, laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Rouen, France;y. Hôpital Universitaire de la Martinique, laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Martinique, France;z. Service de Biologie, Centre Hospitalier d’Antibes Juan les Pins, Antibes, France;11. Service de Parasitologie Mycologie; Sorbonne Université, Inserm, AP-HP, Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière, CNRS, Centre d’Immunologie et des Maladies Infectieuses, Cimi-Paris, 75013 Paris, France;12. Laboratoire multi site d’analyses médicales, Meaux, France;13. CHU Lille, Laboratoire de Parasitologie-Mycologie, 59000 Lille, France;14. Hôpital Universitaire Rennes, laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Rennes, France;15. École nationale vétérinaire d’Alfort, laboratoire de Parasitologie-Mycologie, BioPôle Alfort, Maisons-Alfort, France;16. Sorbonne Université, Inserm, Centre de Recherche St Antoine, CRSA, AP-HP, Hôpital Saint-Antoine, 75012 Paris, France;17. Hôpital Universitaire de Nice, laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Nice, France;18. Laboratoire de Parasitologie Mycologie, CHU de Reims, Hôpital Maison Blanche, 45, rue Cognacq Jay, 51092 Reims cedex, France;19. Hôpital Universitaire de Montpellier, laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Montpellier, France;110. Hôpital d’instruction des armées Bégin, département de biologie médicale, Saint-Mandé, France;111. Laboratoire de Parasitologie et Mycologie, Institut de Biologie, CHU de Nantes, Nantes, France;112. Groupe d’Etude des Interactions Hôte-Pathogène (EA 3142), Université de Brest-Université d’Angers, Hôpital Universitaire de Brest, laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Brest, France;113. Hôpital Universitaire de Strasbourg, laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Strasbourg, France;114. Hôpital Universitaire de Nancy, laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Nancy, France;115. Centre Hospitalier de Valenciennes, laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Valenciennes, France;1p. Service de Parasitologie-Mycologie, CHU Gabriel Montpied, 3IHP, Clermont-Ferrand, France;1q. Hôpital Universitaire de Cochin, laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Paris, France;1r. Aix Marseille Université, IHU Méditerranée Infection, IRD, AP-HM, SSA, VITROME, Marseille, France;1s. Hôpital Universitaire de Nîmes, laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Nîmes, France;1t. Hôpital Universitaire de Dijon, laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Dijon, France;1u. CHU Lille, Laboratoire de Parasitologie Mycologie, University Lille, Inserm U995 -LIRIC, Fungal Associated Invasive & Inflammatory Diseases, 59000 Lille, France;1v. Groupement Hospitalier Paris Saint Joseph, laboratoire de Microbiologie, Paris, France;1w. Service de Microbiologie, Hôpital Européen Georges Pompidou, Unité de Parasitologie-Mycologie, Université Paris Descartes, Paris, France;1. Infectious Diseases Department, Hospital Universitari Vall d’Hebron, Passeig Vall d’Hebron 119-129, 08035 Barcelona, Spain;2. Radiology Department, Hospital Universitari Vall d’Hebron, Barcelona, Spain;3. Neurosurgery Department, Hospital Universitari Vall d’Hebron, Barcelona, Spain;4. Microbiology Department, Hospital Universitari Vall d’Hebron, Barcelona, Spain;1. Student Research Committee, School of Medicine, Mazandaran University of Medical Sciences, Sari, Iran;2. Toxoplasmosis Research Center, Mazandaran University of Medical Sciences, Sari, Iran;3. Health Science Research Center, Addiction Institute, Mazandaran University of Medical Sciences, Sari, Iran;4. Molecular Microbiology Section, Laboratory of Clinical Immunology and Microbiology, National Institute of Allergy and Infectious Diseases, National Institutes of Health, Bethesda, United States;5. Center of Expertise in Microbiology, Infection Biology, and Antimicrobial Pharmacology, Tehran, Iran;6. Invasive Fungi Research Center, Mazandaran University of Medical Sciences, Sari, Iran;7. Department of Medical Mycology, School of Medicine, Mazandaran University of Medical Sciences, Sari, Iran;1. Departamento de Bioquímica, Centro de Biociências, Universidade Federal de Pernambuco, Recife, Pernambuco, Brazil;2. Universidade CEUMA, São Luís, Maranhão, Brazil;3. Núcleo de Bioprospecção da Caatinga, Instituto Nacional do Semiárido, Campina Grande, Paraíba, Brazil;4. Departamento de Antibióticos, Centro de Biociências, Universidade Federal de Pernambuco, Recife, Pernambuco, Brazil;1. Dentistry Student, Federal University of Juiz de Fora, Minas Gerais, Brazil;2. Department of Stomatology, University of São Paulo, São Paulo, Brazil;3. Department of Dental Clinical, Federal University of Juiz de Fora, Minas Gerais, Brazil;1. Service de maladies infectieuses, boulevard Louis-Escande, 71018 Mâcon cedex, France;2. Laboratoire de parasitologie et de mycologie médicale, plateau technique de microbiologie, hôpitaux universitaires de Strasbourg, 1, place de l’hôpital, BP 426, 67091 Strasbourg, France;3. Laboratoire de microbiologie, hôpital Pasteur, hôpitaux civils de Colmar, 39, avenue Liberté, 68024 Colmar cedex, France;4. Laboratoire de microbiologie, centre hospitalier de Mulhouse, site Emile-Muller, 20, avenue Docteur René-Laennec, 68100 Mulhouse, France;5. Service de dermatologie, consultation dermatologie, oncodermatologien, CHU de Strasbourg, hôpital civil, 1, place de l’Hôpital, BP 426, 67091 Strasbourg cedex, France;6. BIOEPAR, Inra, Oniris, 44307 Nantes, France;7. Service des maladies infectieuses et tropicales, 1, place de l’Hôpital, NHC BP 426, 67091 Strasbourg cedex, France;8. Unité d’infectiologie, centre hospitalier de Colmar, 39, avenue de la Liberté, 68024 Colmar, France;1. Laboratoire de parasitologie-mycologie, hôpital Pierre-Zobda-Quitman, CHU de la Martinique, BP 632, 97261 Fort-de-France cedex, Martinique;2. Service de réanimation pédiatrique, hôpital Pierre-Zobda-Quitman, CHU de la Martinique, BP 632, 97261 Fort-de-France cedex, Martinique;3. Service de pédiatrie, hôpital Pierre-Zobda-Quitman, CHU de la Martinique, BP 632, 97261 Fort-de-France cedex, Martinique;4. Service des maladies infectieuses et tropicales, hôpital Pierre-Zobda-Quitman, CHU de la Martinique, BP 632, 97261 Fort-de-France cedex, Martinique;5. Service de neurochirurgie, hôpital Pierre-Zobda-Quitman, CHU de la Martinique, BP 632, 97261 Fort-de-France cedex, Martinique |
| |
| Abstract: | A survey of mycology laboratories for antifungal susceptibility testing (AFST) was undertaken in France in 2018, to better understand the difference in practices between the participating centers and to identify the difficulties they may encounter as well as eventual gaps with published standards and guidelines. The survey captured information from 45 mycology laboratories in France on how they perform AFST (number of strains tested, preferred method, technical and quality aspects, interpretation of the MIC values, reading and interpretation difficulties). Results indicated that 86% of respondents used Etest as AFST method, with a combination of one to seven antifungal agents tested. Most of the participating laboratories used similar technical parameters to perform their AFST method and a large majority used, as recommended, internal and external quality assessments. Almost all the participating mycology laboratories (98%) reported difficulties to interpret the MIC values, especially when no clinical breakpoints are available. The survey highlighted that the current AFST practices in France need homogenization, particularly for MIC reading and interpretation. |
| |
| Keywords: | Antifungal susceptibility testing Etest MIC value interpretation Laboratory practice |
| 本文献已被 ScienceDirect 等数据库收录！ |
|
