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限制性酶切扫描技术测定DNA甲基化组的方法建立
引用本文:秦耘,邓大君,于力.限制性酶切扫描技术测定DNA甲基化组的方法建立[J].中华检验医学杂志,2007,30(9):1040-1044.
作者姓名:秦耘  邓大君  于力
作者单位:1. 北京大学临床肿瘤学院,北京市肿瘤防治研究所病因研究室,北京市肿瘤医院,100036
2. 解放军总医院血液科
基金项目:国家重点基础研究发展计划(973计划)资助项目(2005CB522403/8);国家自然科学基金资助项目(39970318)
摘    要:目的优化试验条件,建立用于DNA甲基化组测定的限制性酶切扫描技术(RLGS)。方法选取冰冻胃癌组织及其周围非癌组织各2份,提取基因组大分子DNA(〉50000bp),用甲基化敏感的限制性内切酶Not Ⅰ等对DNA进行多重酶切、同位素”P标记、二维电泳、扫描分析,并且根据已有的位点DNA序列数据库,确定所得扫描图谱上位点所对应的序列信息。结果成功得到RLGS扫描图;有效点平均在1200个左右,标本质量较好的图谱平均可获得有效点1800个左右,与国外实验室的平均水平相当,经过比对可找出放射自显影信号强度减弱或增强的点,结果可重复,并能在Not Ⅰ-EcoR V克隆文库中找到这些点所对应的序列信息。结论成功建立了RLGS技术平台,并能够稳定工作。

关 键 词:肿瘤  DNA甲基化  DNA限制性酶切扫描技术
修稿时间:2007-02-12

Establishment of restriction landmark genome scanning for detection of genomic DNA methylation of tissues
QIN Yun,DENG Da-jun,YU Li.Establishment of restriction landmark genome scanning for detection of genomic DNA methylation of tissues[J].Chinese Journal of Laboratory Medicine,2007,30(9):1040-1044.
Authors:QIN Yun  DENG Da-jun  YU Li
Abstract:
Keywords:Neoplasms  DNA methylation  DNA restriction landmark genome scanning
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