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基于lncRNA相关ceRNA网络预测冠心病血瘀证分子调控轴
作者姓名:王念  王博  冷媛媛  祁轶斐  李兵  张莹莹  雷蕾  王忠  刘骏
作者单位:1. 中国中医科学院中医临床基础医学研究所;2. 中国中医科学院中药研究所;3. 北京中医药大学东直门医院;4. 中国中医科学院中医药信息研究所
摘    要:
目的 通过长链非编码RNA(lncRNA)相关竞争性内源RNA(ceRNA)网络构建及分析,探讨冠心病血瘀证发生发展机制。方法 通过HMDD、DisGeNET、OMIM、GeneCards、TTD、lncRNADisease数据库查找冠心病血瘀证相关基因,并通过starBase平台构建lncRNA相关ceRNA网络,采用MCODE、MCL、GLay方法识别功能模块,基于最小结构熵确定最优模块识别方法,筛选包含lncRNA、miRNA、mRNA的模块,通过文献预测模块中潜在的调控轴。结果 ceRNA网络共有283个节点,由72个miRNA、182个mRNA、29个lncRNA和4 990个调控关系组成,共划分为11个功能模块,发现UCA1-miR-1-G6PD调控轴,其中miR-1抑制G6PD表达导致冠状动脉疾病的发生,而UCA1能够解除miR-1的抑制从而恢复G6PD正常表达。结论 UCA1-miR-1-G6PD分子调控轴与冠心病血瘀证相关;可通过ceRNA网络的模块化分析开展病证相关研究。

关 键 词:冠心病  血瘀证  竞争性内源RNA  长链非编码RNA  调控轴  模块药理学
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