| 基于生物信息学分析的自噬相关基因构建肺鳞状细胞癌预后模型及验证题录 |
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| 作者姓名： | 武献珍 刘娇娇 原琦 王宏志 |
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| 作者单位： | 1. 山西省肿瘤医院 中国医学科学院肿瘤医院山西医院 山西医科大学附属肿瘤医院呼吸科;2. 山西医科大学第一医院耳鼻咽喉头颈外科;3. 山西省肿瘤医院 中国医学科学院肿瘤医院山西医院 山西医科大学附属肿瘤医院消化科;4. 山西省肿瘤医院 中国医学科学院肿瘤医院山西医院 山西医科大学附属肿瘤医院麻醉科 |
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| 摘 要： | ![]()
目的基于生物信息学分析的自噬相关基因构建肺鳞状细胞癌(SqCLC)预后模型并验证。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载268例SqCLC患者的表达谱数据和临床信息, 从基因型组织表达(GTEx)数据库下载336名健康人正常肺组织的数据集;从人类自噬数据库(HADb)及分子特征数据库(MSigDB)6.2中的GOAUTOPHAGY基因组中获得自噬相关基因组。应用R 4.0.3软件分析TCGA数据库中SqCLC组织与GTEx数据库中正常肺组织间差异表达基因。使用R 4.0.3软件筛选TCGA数据库SqCLC组织和正常肺组织间差异表达的自噬相关基因(简称:差异表达自噬基因)。应用Cox比例风险模型分析TCGA数据库SqCLC患者差异表达自噬基因与预后的关系, 构建预后模型。依据预后模型风险评分中位数将TCGA数据库SqCLC患者分为高风险组和低风险组, 采用Kaplan-Meier法比较两组总生存;绘制应用预后模型预测的TCGA数据库268例患者3、5、10年总生存率的时间相关受试者工作特征(ROC)曲线。采用Cox回归分析TCGA数据库SqCLC患者总生存的独立...
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| 关 键 词： | 肺肿瘤 癌, 鳞状细胞 自噬 预后 计算生物学 |
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