新疆地区蓝舌病病毒的分离鉴定及编码VP5外壳蛋白的基因序列分析

对分离的新疆蓝舌病病毒（BTV）株编码VP5蛋白的S6基因序列进行比对分析，旨在了解分离毒株的基因遗传变异及进化关系，以期为新疆地区蓝舌病疫苗研究提供科学依据。本研究对绵羊全血中分离的疑似BTV分离毒株，提取RNA进行NS1-PCR扩增，克隆测序。应用全长cDNA扩增（full-length amplification of cDNAs,FLAC）技术获得S6基因序列，NCBI Blast比对S6基因同源性，MEGA5.0软件绘制进化树，分析BTV新疆分离株与蓝舌病病毒28个血清型S6基因的序列遗传进化关系。结果表明，新疆地区疑似蓝舌病病毒分离株NS1片段与蓝舌病病毒NS1片段序列相似性为98.04%，获得1株蓝舌病病毒。BTV分离株S6基因序列仅与GenBank中BTV strain XJ1407株、BTV strainMNG2/2016株及BTV-18 strain USA2014/FL株的S6基因具有同源性，且同源性均低于90%，分别为88.11%,87.35%以及70.92%。BTV分离株S6基因序列进化关系分析结果表明，分离株与BTV-18血清型在同一进化分支，与BTV-27...