| 应用R语言MetaOmics分析流程实现基因芯片数据的Meta分析 |
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| 作者单位： | ;1.武汉大学中南医院循证与转化医学中心/武汉大学第二临床学院循证医学与临床流行病学教研室/武汉大学循证与转化医学中心;2.河南大学淮河医院循证医学中心/科教科/泌尿外科;3.河南中医药大学第一附属医院心内科/河南中医药大学循证医学中心 |
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| 摘 要： | 随着基因芯片技术的发展和检测成本的下降,近年来成千上万的基因表达谱研究被公开发表,因此基于基因表达芯片数据的Meta分析对于进一步验证具有重要意义。美国匹兹堡大学研究人员开发的基于R语言的MetaOmics分析流程目前包含的MetaQC、MetaDE和MetaPath程序包,可分别用于基因芯片数据Meta分析质量控制、差异基因筛选以及后续功能分析。本文以9例前列腺癌基因表达谱研究为例,介绍通过MetaOmics基因芯片数据实现Meta分析的具体步骤,为其临床应用提供参考。
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| 关 键 词： | Meta分析 基因芯片数据 MetaOmcis分析流程 R语言 |
Application Meta Analysis of Microarray Studies Using the R pipeline MetaOmics |
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