酶显色法基因芯片检测幽门螺杆菌克拉霉素耐药基因 |
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引用本文: | 宣世海,景奉香,金庆辉,周玉贵,邵柏,崔亚林,周洁,王琴,徐康,王惠民,褚少朋. 酶显色法基因芯片检测幽门螺杆菌克拉霉素耐药基因[J]. 中华医院感染学杂志, 2009, 19(24): 3325-3329 |
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作者姓名: | 宣世海 景奉香 金庆辉 周玉贵 邵柏 崔亚林 周洁 王琴 徐康 王惠民 褚少朋 |
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作者单位: | 1. 南通大学附属东台医院检验科,江苏,东台,224200 2. 中国科学院上海微系统与信息技术研究所生物芯片实验室,上海,200050 3. 南通大学附属医院检验医学中心,江苏,南通,226001 |
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基金项目: | 江苏省医学重点建设学科资助项目 |
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摘 要: | 目的 建立酶显色法基冈芯片快速、准确检测幽门螺杆菌(Hp)克拉霉素耐药基因.方法 设计-对引物,以地高辛标记其中一条引物,扩增Hp 23S rRNA部分基因,得到285 bp DNA片段.根据23S rRNA上的5个位点设计探针和制作芯片,扩增产物与芯片杂交,酶显色后扫描判读结果.结果 63例Hp阳性标本中,芯片结果显示突变率:A2143G为3.17%、T2182C为11.11%、A2143G+T2182C为14.29%;酶显色法芯片和DNA直接测序法检测Hp 23S rRNA基因多态性结果符合率为96.83%;质粒浓度为1.53×10~2拷贝/μl时芯片法仍可检测到野生和突变信号.结论 酶显色法芯片检测实现了高通量的同时具有较高敏感性和特异性,能同时检测23S rRNA的多种突变型,无需特殊仪器,可以用于指导临床合理用药和进行流行病学调查,有一定的临床应用价值.
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关 键 词: | 基因芯片 幽门螺杆菌 克拉霉素 耐药 |
Detection of Gene from Helicobacter Pylori Associated with Clarithromycin Resistance by Using Coloration Gene Chips |
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Abstract: |
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Keywords: | Gene chip Helicobacter pylori Clarithromycin Resistance |
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