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COMMD7在脑低级别胶质瘤发生发展中作用机制的生物信息学分析
作者姓名:王小燕  胡溢洪  韩语诚  邹先琼
作者单位:1. 桂林医学院智能医学与生物技术学院实验教学中心;2. 广西高校生物化学与分子生物学重点实验室;3. 桂林医学院智能医学与生物技术学院生物医学工程教研室
基金项目:国家自然科学基金项目(82160185);
摘    要:目的:通过生物信息学方法分析COMM域包含蛋白质7 (COMMD7)的表达水平与脑低级别胶质瘤(LGG)患者预后之间的关系,以期寻找脑LGG新的潜在生物标志物,并建立预后预测模型,为患者预后预测及个性化治疗提供依据。方法:从UCSC基因组数据库下载523个脑LGG样本和1 152正常样本的数据。采用Mann-Whitney U检验分析COMMD7在脑LGG样本和正常样本中的表达差异,并采用人类蛋白图谱(HPA)数据库进行验证。使用R语言的DESeq软件包对COMMD7低表达组和COMMD7高表达组脑LGG样本进行差异表达基因(DEGs)鉴定,采用R语言的pROC软件包进行受试者工作特征(ROC)曲线分析,采用单因素和多因素Cox回归分析COMMD7表达与脑LGG患者临床病理特征的关系及对脑LGG患者1、3和5年生存率的影响,采用R语言的ggplot2软件包构建森林图,采用R语言的RMS软件包和Survival软件包构建列线图和Calibration预测模型,采用比例风险回归模型分析COMMD7用于区分脑LGG样本和正常样本的诊断价值。采用GEPIA数据库及Oncolnc数据库进一步验证...

关 键 词:COMM域包含蛋白质7  脑低级别胶质瘤  生物信息学  预后  免疫浸润
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