高通量测序分析类风湿关节炎患者外周血单个核细胞circRNAs表达谱差异

目的探讨类风湿关节炎(RA)患者外周血单个核细胞(PBMCs)中环状RNA (circRNA)表达谱的差异,并结合临床验证筛选出可辅助RA诊断的分子标志物。方法采用高通量测序技术,检测4例RA患者和3例健康对照者PBMCs中circRNA和mRNA表达;基因聚类分析差异表达的circRNAs,KEGG pathway分析差异表达的mRNAs;采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)方法在32例RA患者和20例健康对照者中验证部分差异表达circRNAs,结合ROC曲线分析其作为RA诊断分子标志物的潜力。结果高通量测序结果显示,RA组和健康对照组中共有71种显著差异表达的circRNAs,其中41种上调,30种下调,生物信息学分析显示,涉及的通路多与炎症和转录活性相关。多样本qRT-PCR验证结果显示hsa_circ_0000396和hsa_circ_0130438在RA患者PBMCs中的表达水平显著低于健康对照组(P0.05),ROC曲线分析进一步表明显示hsa_circ_0000396有望成为RA诊断分子标志物。结论在RA患者PBMCs中存在差异表达的circRNAs,它们在RA的发生发展过程中可能起调控作用,其中hsa_circ_0000396有成为RA诊断分子标志物的潜能。